More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1326 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
421 aa  791    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.97 
 
 
406 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  59.9 
 
 
418 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.11 
 
 
420 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.93 
 
 
422 aa  363  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.9 
 
 
416 aa  348  8e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.47 
 
 
475 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  49.36 
 
 
410 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.82 
 
 
403 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.55 
 
 
405 aa  316  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.75 
 
 
426 aa  315  8e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.33 
 
 
448 aa  308  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.27 
 
 
426 aa  302  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.73 
 
 
447 aa  298  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.33 
 
 
398 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.33 
 
 
398 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.33 
 
 
398 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.23 
 
 
411 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.04 
 
 
410 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.89 
 
 
402 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.1 
 
 
394 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50 
 
 
407 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.85 
 
 
419 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.59 
 
 
426 aa  289  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  45.55 
 
 
405 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  45.66 
 
 
490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.72 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.61 
 
 
419 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.75 
 
 
405 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.74 
 
 
417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
413 aa  265  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.25 
 
 
414 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.93 
 
 
385 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  35.44 
 
 
470 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.08 
 
 
479 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  35.65 
 
 
473 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  35.65 
 
 
473 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.92 
 
 
502 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  34.95 
 
 
459 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  37.14 
 
 
465 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.14 
 
 
478 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  36.08 
 
 
476 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  48.74 
 
 
516 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0711  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63 
 
 
261 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  36.69 
 
 
465 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.07 
 
 
491 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  35.63 
 
 
464 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.87 
 
 
464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  35.41 
 
 
464 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00850  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.66 
 
 
340 aa  223  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.86 
 
 
329 aa  222  9e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1791  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.41 
 
 
255 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.693099  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.02 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  51.05 
 
 
520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.56 
 
 
271 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  33.33 
 
 
462 aa  220  3e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2200  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.87 
 
 
261 aa  221  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0396322  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.11 
 
 
479 aa  219  7.999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.98 
 
 
531 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.9 
 
 
245 aa  219  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.28 
 
 
464 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1304  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.46 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1712  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.32 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1257  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.09 
 
 
344 aa  217  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0347  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.81 
 
 
464 aa  216  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.354994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
250 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.75 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.05 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
288 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.75 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.59 
 
 
276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.1 
 
 
250 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.53 
 
 
493 aa  213  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.51 
 
 
463 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.52 
 
 
504 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.53 
 
 
481 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.52 
 
 
250 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  54.24 
 
 
513 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.54 
 
 
502 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  35.73 
 
 
472 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.1 
 
 
505 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
513 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.05 
 
 
463 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.41 
 
 
489 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  33.93 
 
 
459 aa  209  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.65 
 
 
482 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  35.51 
 
 
472 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.06 
 
 
258 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  34.08 
 
 
468 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
497 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  33.26 
 
 
472 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.51 
 
 
472 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.62 
 
 
480 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.92 
 
 
462 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.84 
 
 
512 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.67 
 
 
277 aa  207  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.12 
 
 
472 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
239 aa  206  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.46 
 
 
462 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.78 
 
 
258 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>