More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1703 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
411 aa  786    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  65.84 
 
 
398 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  65.84 
 
 
398 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  65.84 
 
 
398 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  65.24 
 
 
405 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.33 
 
 
402 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.14 
 
 
403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.58 
 
 
413 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.54 
 
 
405 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  56.5 
 
 
410 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  63.32 
 
 
414 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.24 
 
 
405 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.1 
 
 
448 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.25 
 
 
426 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.23 
 
 
394 aa  363  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.4 
 
 
410 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.59 
 
 
407 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.82 
 
 
426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.39 
 
 
419 aa  354  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.81 
 
 
419 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.03 
 
 
417 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.53 
 
 
406 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50 
 
 
475 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.22 
 
 
418 aa  279  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.61 
 
 
422 aa  273  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.22 
 
 
420 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.23 
 
 
421 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  42.67 
 
 
490 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.86 
 
 
553 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.89 
 
 
329 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.95 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.48 
 
 
403 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.17 
 
 
276 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.67 
 
 
447 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.43 
 
 
385 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.92 
 
 
570 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.89 
 
 
271 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.22 
 
 
491 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.74 
 
 
512 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.63 
 
 
479 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.51 
 
 
508 aa  216  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.48 
 
 
550 aa  216  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.59 
 
 
504 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
258 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.22 
 
 
258 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.81 
 
 
258 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.22 
 
 
258 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.06 
 
 
505 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
258 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
258 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
258 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
258 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.38 
 
 
258 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.71 
 
 
493 aa  206  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.45 
 
 
271 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.54 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.39 
 
 
264 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  44.12 
 
 
516 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  52.79 
 
 
513 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.22 
 
 
512 aa  203  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.64 
 
 
502 aa  202  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.26 
 
 
504 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.89 
 
 
508 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  31.71 
 
 
470 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2200  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.98 
 
 
261 aa  199  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0396322  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  33.11 
 
 
457 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.84 
 
 
258 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.35 
 
 
272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  31.03 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.03 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  31.03 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  33.11 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.98 
 
 
507 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.11 
 
 
250 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.99 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  32.89 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  31.03 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.74 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  33.11 
 
 
459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  31.03 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  31.03 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.84 
 
 
263 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00850  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.43 
 
 
340 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1791  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.71 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.693099  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  32.89 
 
 
457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.71 
 
 
506 aa  196  5.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  32.6 
 
 
473 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  30.8 
 
 
457 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.49 
 
 
426 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  45.38 
 
 
520 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  32.6 
 
 
473 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.54 
 
 
245 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.93 
 
 
275 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.97 
 
 
250 aa  193  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.7 
 
 
259 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.96 
 
 
256 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.98 
 
 
261 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.5 
 
 
511 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.06 
 
 
510 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>