More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0528 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
508 aa  945    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  81.25 
 
 
570 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  34.05 
 
 
516 aa  273  7e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.77 
 
 
505 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  44.67 
 
 
505 aa  264  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.88 
 
 
512 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  40.5 
 
 
513 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  40 
 
 
520 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.25 
 
 
504 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.94 
 
 
504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.9 
 
 
507 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.89 
 
 
519 aa  253  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.15 
 
 
503 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.59 
 
 
413 aa  251  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.84 
 
 
503 aa  249  7e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  59.57 
 
 
426 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.86 
 
 
503 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  57.69 
 
 
405 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.59 
 
 
497 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.04 
 
 
448 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.02 
 
 
403 aa  246  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.74 
 
 
506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
497 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.65 
 
 
402 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.57 
 
 
492 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.73 
 
 
511 aa  240  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.26 
 
 
512 aa  240  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.98 
 
 
398 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.98 
 
 
398 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.98 
 
 
419 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.98 
 
 
398 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.07 
 
 
522 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.43 
 
 
510 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.97 
 
 
419 aa  237  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.2 
 
 
276 aa  236  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.05 
 
 
250 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.67 
 
 
511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.17 
 
 
405 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.11 
 
 
504 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.5 
 
 
508 aa  233  7.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.93 
 
 
329 aa  233  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.84 
 
 
406 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.3 
 
 
475 aa  232  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.83 
 
 
507 aa  230  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  51.74 
 
 
410 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.61 
 
 
271 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.71 
 
 
502 aa  230  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.87 
 
 
407 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.17 
 
 
511 aa  229  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  41.9 
 
 
513 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.51 
 
 
411 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.2 
 
 
510 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.63 
 
 
525 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.48 
 
 
513 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.85 
 
 
493 aa  226  9e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.97 
 
 
426 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0496  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.78 
 
 
552 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.28 
 
 
245 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  35.78 
 
 
515 aa  223  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.74 
 
 
491 aa  223  9e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1233  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.28 
 
 
254 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323489  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.49 
 
 
509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.95 
 
 
410 aa  220  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.63 
 
 
414 aa  219  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.31 
 
 
250 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.74 
 
 
405 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.43 
 
 
385 aa  216  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.02 
 
 
579 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.15 
 
 
256 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1791  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
255 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.693099  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
250 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.63 
 
 
258 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.63 
 
 
249 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.27 
 
 
417 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.93 
 
 
546 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.42 
 
 
502 aa  207  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  46.18 
 
 
462 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.98 
 
 
258 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.38 
 
 
277 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.75 
 
 
416 aa  206  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
282 aa  206  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0608  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
245 aa  206  9e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807775  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  44.21 
 
 
459 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  33.84 
 
 
492 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.39 
 
 
258 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.23 
 
 
275 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.8 
 
 
258 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.87 
 
 
512 aa  205  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.91 
 
 
506 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1712  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.18 
 
 
464 aa  205  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.98 
 
 
422 aa  205  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.23 
 
 
493 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.39 
 
 
258 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.39 
 
 
258 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
259 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.39 
 
 
258 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.39 
 
 
258 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  44.21 
 
 
459 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.55 
 
 
553 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1199  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.9 
 
 
491 aa  204  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>