56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1589 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1589  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.603867  normal  0.335137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4844  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  90.85 
 
 		 142 aa  270  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1230  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  85.21 
 
 		 142 aa  258  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490436  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1256  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  85.21 
 
 		 142 aa  258  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1247  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  85.21 
 
 		 142 aa  258  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13347  succinate dehydrogenase cytochrome B-556 subunit sdhC  75.83 
 
 		 144 aa  193  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.262183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1778  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  69.84 
 
 		 139 aa  187  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1311  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  68.18 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6462  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  71.43 
 
 		 140 aa  167  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0681  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  65.81 
 
 		 131 aa  167  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.0350115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0967  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  58.09 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25800  succinate dehydrogenase subunit C  71.29 
 
 		 126 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180508  normal  0.930468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2950  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  64.81 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3952  Succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  56.59 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0821  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  68.32 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0772  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  59.09 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1017  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  65.38 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05380  succinate dehydrogenase subunit C  71.13 
 
 		 116 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0990  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  63.89 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21310  succinate dehydrogenase subunit C  67.68 
 
 		 125 aa  146  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1204  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  59.43 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000580451 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04850  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  55.28 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1131  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  58.49 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0787  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  43.81 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0188  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  37.5 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0208  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  41.07 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0889  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  38.78 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.891271  normal  0.65854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2257  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.64 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0160285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2516  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.28 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1435  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.58 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.362976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2835  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.06 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.178148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0933  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  32.18 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3125  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.46 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2076  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  28.95 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3148  putative succinate dehydrogenase cytochrome b-556 subunit  26.26 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.80265  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3885  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  26.26 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04840  succinate dehydrogenase subunit D  30 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1124  putative succinate dehydrogenase cytochrome b subunit  28.18 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.454287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2195  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  32.88 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0820  Succinate dehydrogenase hydrophobic anchor subunit-like protein  27.56 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4193  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.43 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.530712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1610  succinate dehydrogenase subunit C  29.1 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467782  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44060  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.63 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1661  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.43 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3693  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  33.67 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3764  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.43 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3516  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.43 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1113  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  27.17 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.405795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3968  succinate dehydrogenase subunit C  29.7 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.617218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2005  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.88 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0924289  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3784  hypothetical protein  28.32 
 
 		 133 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1987  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.03 
 
 		 142 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.241729  normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2507  succinate dehydrogenase subunit C  27.78 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1795  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.43 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000214378  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2951  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  28.16 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1016  succinate dehydrogenase hydrophobic anchor subunit-like protein  28 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>