41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3952 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3952  Succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1017  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  68.75 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1204  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  69.23 
 
 		 126 aa  175  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000580451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25800  succinate dehydrogenase subunit C  69.17 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180508  normal  0.930468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1131  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  68.33 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0821  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  68.33 
 
 		 126 aa  171  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2950  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  70.09 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21310  succinate dehydrogenase subunit C  70.49 
 
 		 125 aa  168  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0990  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  66.94 
 
 		 126 aa  166  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0772  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  63.71 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04850  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  61.34 
 
 		 134 aa  157  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1311  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  59.06 
 
 		 143 aa  156  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1230  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  56.59 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490436  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1247  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  56.59 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1589  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  56.59 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.603867  normal  0.335137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1256  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  56.59 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6462  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  61.67 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0681  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  57.85 
 
 		 131 aa  154  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.0350115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13347  succinate dehydrogenase cytochrome B-556 subunit sdhC  61.21 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.262183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4844  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  58.54 
 
 		 142 aa  151  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1778  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  53.73 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05380  succinate dehydrogenase subunit C  58.04 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0967  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  57.14 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0787  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  42.45 
 
 		 119 aa  104  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0188  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  36.29 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0889  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  38.18 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.891271  normal  0.65854 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1435  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  38.89 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.362976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0208  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  44.68 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2516  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.34 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2257  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.87 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0160285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2835  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  28.83 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.178148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0933  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  32.26 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2076  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.25 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3125  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  28.16 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3968  succinate dehydrogenase subunit C  31.65 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.617218 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3885  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  31.65 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3148  putative succinate dehydrogenase cytochrome b-556 subunit  31.65 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.80265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0786  Succinate dehydrogenase hydrophobic anchor subunit-like protein  32.58 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1987  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.12 
 
 		 142 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.241729  normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1125  succinate dehydrogenase cytochrome b-556 subunit  29.29 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.504546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3516  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.12 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>