47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2516 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2516  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  100 
 
 		 154 aa  310  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2257  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  63.91 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0160285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0208  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  43.12 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1131  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  37.86 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1204  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  36.89 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000580451 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0188  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  36.84 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0821  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  39.81 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3952  Succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  35.34 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013264 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0787  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  38.26 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1778  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.65 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25800  succinate dehydrogenase subunit C  36.11 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180508  normal  0.930468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2950  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  33.66 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0772  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  36.89 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21310  succinate dehydrogenase subunit C  36.56 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1311  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  33.33 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1256  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  28.79 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1230  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  28.79 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490436  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0990  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.64 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1247  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  28.79 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04850  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.95 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6462  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.43 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4844  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  28.79 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1017  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.78 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05380  succinate dehydrogenase subunit C  30.3 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1589  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  30.28 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.603867  normal  0.335137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0967  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0933  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  41.41 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0889  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  33.98 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.891271  normal  0.65854 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0681  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  29.31 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.0350115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13347  succinate dehydrogenase cytochrome B-556 subunit sdhC  28.42 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.262183 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2835  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  36.7 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.178148  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3885  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  38.71 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3148  putative succinate dehydrogenase cytochrome b-556 subunit  38.71 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.80265  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2076  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.13 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3125  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  32.43 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1435  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.29 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.362976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1987  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  33.04 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.241729  normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2803  succinate dehydrogenase hydrophobic membrane anchor  26.42 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.102874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3968  succinate dehydrogenase subunit C  37.04 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.617218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1151  succinate dehydrogenase, hydrophobic anchor subunit  28.3 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1124  putative succinate dehydrogenase cytochrome b subunit  29.03 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.454287  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04840  succinate dehydrogenase subunit D  28.7 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1130  succinate dehydrogenase subunit D  23.97 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0888  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  31 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.909665  normal  0.65854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21320  succinate dehydrogenase subunit D  26.72 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2256  succinate dehydrogenase, membrane subunit, putative  26.32 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0904861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1333  succinate dehydrogenase subunit D  28.7 
 
 		 126 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>