47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13347 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13347  succinate dehydrogenase cytochrome B-556 subunit sdhC  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.262183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1589  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  75.83 
 
 		 142 aa  193  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.603867  normal  0.335137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4844  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  65.96 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1230  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  65.25 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490436  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1256  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  65.25 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1247  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  65.25 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1778  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  64 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1311  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  60.48 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0681  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  59.02 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.0350115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25800  succinate dehydrogenase subunit C  65.42 
 
 		 126 aa  157  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180508  normal  0.930468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6462  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  60.66 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0967  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  60.68 
 
 		 134 aa  155  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226571  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3952  Succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  61.21 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0821  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  65.66 
 
 		 126 aa  151  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2950  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  67.71 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1017  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  67.35 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0772  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  57.52 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05380  succinate dehydrogenase subunit C  66.67 
 
 		 116 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0990  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  58.88 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1204  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  56.88 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000580451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1131  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  56.88 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21310  succinate dehydrogenase subunit C  65.96 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04850  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  51.28 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0787  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  38.74 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0188  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.25 
 
 		 138 aa  84.7  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0208  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  37.6 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0889  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  37.36 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.891271  normal  0.65854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2257  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  37.5 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0160285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2835  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  36.17 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.178148  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1435  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  36.27 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.362976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2516  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  28.42 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0933  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.58 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3125  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.09 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2076  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.58 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1113  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  26.32 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.405795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3148  putative succinate dehydrogenase cytochrome b-556 subunit  26.26 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.80265  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3885  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  26.26 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3968  succinate dehydrogenase subunit C  30.23 
 
 		 114 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.617218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0786  Succinate dehydrogenase hydrophobic anchor subunit-like protein  33.71 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2195  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  28.16 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1610  succinate dehydrogenase subunit C  30.21 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467782  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2005  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  28.16 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0924289  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1987  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  28.92 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.241729  normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3516  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  26.39 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1661  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  26.39 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3764  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  26.39 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4193  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  26.39 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.530712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>