49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1247 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1230  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490436  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1256  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1247  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1589  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  85.21 
 
 		 142 aa  258  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.603867  normal  0.335137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4844  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  81.69 
 
 		 142 aa  252  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13347  succinate dehydrogenase cytochrome B-556 subunit sdhC  65.25 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.262183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1311  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  65.35 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1778  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  68.14 
 
 		 139 aa  176  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6462  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  71.43 
 
 		 140 aa  166  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0967  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  71.43 
 
 		 134 aa  164  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226571  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0681  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  62.39 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.0350115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25800  succinate dehydrogenase subunit C  70.37 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180508  normal  0.930468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05380  succinate dehydrogenase subunit C  76.29 
 
 		 116 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0821  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  68.52 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0772  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  61.82 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3952  Succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  56.59 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1204  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  65.09 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000580451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1017  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  66.67 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2950  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  64.81 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1131  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  64.15 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0990  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  64.81 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21310  succinate dehydrogenase subunit C  61.67 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04850  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  51.61 
 
 		 134 aa  140  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0787  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  44.86 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0188  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.77 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0889  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  43.88 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.891271  normal  0.65854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0208  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.29 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2516  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  28.79 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1435  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.55 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.362976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2257  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.86 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0160285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2835  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.31 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.178148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0933  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.58 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2076  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  26.32 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3148  putative succinate dehydrogenase cytochrome b-556 subunit  27.27 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.80265  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3125  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  26.97 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3885  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  27.27 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04840  succinate dehydrogenase subunit D  26.92 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3784  hypothetical protein  30.11 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1113  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  29.85 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.405795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0820  Succinate dehydrogenase hydrophobic anchor subunit-like protein  26.8 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2195  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  32.88 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0966  succinate dehydrogenase cytochrome b subunit  26.19 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3516  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.43 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2951  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  27.18 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1967  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  28.97 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4193  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.43 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.530712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1795  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  32.43 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000214378  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1661  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.43 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3764  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.43 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>