More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2175 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2175  parB-like partition protein  100 
 
 		 322 aa  657    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1094  parB-like partition proteins  33.8 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0765173  hitchhiker  0.00022246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  32.47 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  32.47 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  32.47 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  32.7 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  28.19 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  32.39 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  32 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  31.58 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  41.76 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  28.95 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7548  parB-like partition protein  32.21 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  45.07 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  29.1 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  28.51 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  34.33 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  31.29 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  34 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  28.76 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  31.16 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  32.03 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  32.47 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  30 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  30.65 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  29.93 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  41.57 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  29.38 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  34.15 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  33.74 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  29.95 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  26.41 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  31.37 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  32.48 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  31.97 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  28.95 
 
 		 422 aa  65.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  35.64 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  30.69 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  30.69 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  36.05 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  26.75 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  27.54 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  27.43 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  30.13 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  28.66 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  30.82 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  26.41 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  27.5 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  27.5 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  39.6 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  29.68 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  28.28 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  38.2 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  30.36 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  29.09 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  29.63 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  31.68 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  29.03 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  35.04 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  29.56 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  29.63 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  33.88 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  27.95 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  26.56 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  31.31 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  28.4 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  31.88 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  29.53 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  28.48 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  29.38 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  34.43 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1531  stage 0 sporulation protein J  35.58 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  27.4 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  27.44 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  30 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  32.52 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  31.48 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  32.95 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  28.14 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  31.48 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  36.17 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  37.65 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  29.53 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  34.15 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  30 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  29.11 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  38.82 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  31.48 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  31.48 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  35.56 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  31.48 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  38.04 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  31.48 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  38.78 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  30.86 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  28.14 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  30.26 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>