110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0855 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0855  methyltransferase type 11  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.233642  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0704  methyltransferase type 11  36.42 
 
 
170 aa  92.8  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0858444 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0754  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.251541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1269  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 
263 aa  55.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 
275 aa  55.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  24.63 
 
 
219 aa  55.1  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.26 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
311 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
199 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 
283 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0377  demethylmenaquinone methyltransferase  26.67 
 
 
258 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370247  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  31.78 
 
 
351 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_341  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase  26.67 
 
 
258 aa  52  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
253 aa  52  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
253 aa  51.6  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.63 
 
 
299 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  25.56 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.3 
 
 
232 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  30.84 
 
 
351 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 
286 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  34.07 
 
 
267 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.46 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  41.18 
 
 
240 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
305 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
305 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
227 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.25 
 
 
220 aa  48.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
263 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  28.91 
 
 
351 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  25 
 
 
207 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  25 
 
 
207 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  28.78 
 
 
291 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
261 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 
266 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2332  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.71 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000815001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
268 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
268 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  28.78 
 
 
291 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  30.59 
 
 
274 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
363 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  26.36 
 
 
305 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  27.78 
 
 
288 aa  45.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  26.87 
 
 
272 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  30.59 
 
 
274 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
300 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
221 aa  45.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
391 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
295 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  32.65 
 
 
233 aa  44.7  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.06 
 
 
251 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
300 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
304 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  31.09 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  28.89 
 
 
268 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
317 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  31 
 
 
314 aa  44.3  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  27.93 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0386  methyltransferase  22.73 
 
 
225 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.95 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1634  hypothetical protein  27.01 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.91 
 
 
202 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 
226 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  35.71 
 
 
306 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  30 
 
 
275 aa  42.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  28.37 
 
 
291 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
213 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  28.99 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1927  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
209 aa  42.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170226  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
268 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.27 
 
 
207 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.33 
 
 
321 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  26.14 
 
 
231 aa  42.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1590  methyltransferase  30.17 
 
 
219 aa  42.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  23.64 
 
 
487 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  27.52 
 
 
351 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  26.32 
 
 
253 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  26.32 
 
 
253 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  26.12 
 
 
284 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.47 
 
 
237 aa  42  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  25.45 
 
 
313 aa  42  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  24.17 
 
 
289 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  28.99 
 
 
210 aa  42  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.3 
 
 
233 aa  42  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  28.44 
 
 
285 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
208 aa  41.6  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  24.57 
 
 
257 aa  42  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  25.38 
 
 
239 aa  41.6  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3751  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 
243 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  23.33 
 
 
258 aa  41.2  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  26.74 
 
 
269 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
321 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  28.41 
 
 
303 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  28.41 
 
 
303 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
281 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  25.51 
 
 
285 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.48 
 
 
305 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
321 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  26.42 
 
 
239 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>