96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5990 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5990  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 
341 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.626097 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3889  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.02 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  0.125658 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3152  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.02 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1728  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  51.31 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3455  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  44.3 
 
 
347 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2677  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.27 
 
 
343 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0340  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.46 
 
 
339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6250  ABC transporter substrate binding protein  45.71 
 
 
351 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126747  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3603  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.96 
 
 
350 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6535  ABC transporter substrate binding protein  45.4 
 
 
351 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6588  ABC transporter substrate binding protein  45.4 
 
 
343 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6192  ABC transporter substrate binding protein  45.4 
 
 
343 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1244  ABC transporter substrate binding protein  45.4 
 
 
343 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03032  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  45.83 
 
 
346 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.08661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30880  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.27 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2205  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.81 
 
 
337 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1388  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.14 
 
 
317 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5195  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.67 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3151  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.22 
 
 
330 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4137  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  43.04 
 
 
341 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19179  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2170  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.96 
 
 
350 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541715  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3888  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.89 
 
 
330 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.56 
 
 
350 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1399  ABC transporter periplasmic binding protein  41.69 
 
 
341 aa  261  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0512  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.45 
 
 
366 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1299  ABC transporter periplasmic binding protein  44.63 
 
 
362 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1797  ABC transporter periplasmic binding protein  41.38 
 
 
340 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3450  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.67 
 
 
343 aa  258  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302208  hitchhiker  0.000774086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4888  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  42.76 
 
 
332 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal  0.144986 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6049  ABC transporter substrate binding protein  44.44 
 
 
351 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  42.21 
 
 
338 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.22 
 
 
334 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30920  ABC transporter, periplasmic binding protein  39.81 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.67 
 
 
345 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00383664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34770  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  41.5 
 
 
340 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.0167014 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1687  ABC transporter substrate binding protein  41.85 
 
 
348 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2032  ABC transporter substrate binding protein  41.85 
 
 
348 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0343  ABC transporter substrate-binding protein  41.85 
 
 
348 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1866  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.85 
 
 
348 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1878  ABC transporter substrate binding protein  41.85 
 
 
348 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0818  ABC transporter substrate binding protein  41.85 
 
 
348 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4122  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  42.14 
 
 
342 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4009  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  42.14 
 
 
342 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368962  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  41.88 
 
 
338 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6690  putative periplasmic substrate-binding subunit (ABC transporter)  42.12 
 
 
338 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1120  ABC transporter, periplasmic binding protein  40.79 
 
 
334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0138  NLPA lipoprotein  40.07 
 
 
341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4505  NLPA lipoprotein  40.58 
 
 
342 aa  245  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.826664  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0191  ABC transporter periplasmic-binding protein  38.48 
 
 
339 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0170  ABC transporter, periplasmic binding protein  38.48 
 
 
339 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0189  ABC transporter, periplasmic binding protein  40.07 
 
 
339 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.366153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5057  ABC transporter, periplasmic binding protein  38.18 
 
 
339 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2525  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  38.94 
 
 
338 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74884  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0536  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  39.74 
 
 
342 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00532956  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5060  ABC transporter substrate-binding protein  38.26 
 
 
327 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1606  NLPA lipoprotein  39.8 
 
 
346 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000297803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3930  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.79 
 
 
341 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3590  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.79 
 
 
341 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102161  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6244  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  36.72 
 
 
334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3496  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.99 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0231638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5326  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.99 
 
 
338 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3259  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  34.63 
 
 
336 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5095  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.93 
 
 
119 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.296668  normal  0.288347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5012  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30 
 
 
369 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0114898  normal  0.178041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0183  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.92 
 
 
345 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.81 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  27.73 
 
 
349 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  27.57 
 
 
361 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19360  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  24.07 
 
 
365 aa  49.3  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.429227  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3137  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  29.52 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.84 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5414  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.74 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.445951  hitchhiker  0.00207004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1211  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.94 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30510  ABC transporter periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  29.81 
 
 
320 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.846388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  25.41 
 
 
349 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2789  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.55 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31360  ABC transporter periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  27.63 
 
 
323 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.694075  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2224  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  28.95 
 
 
327 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455762  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0207  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  25 
 
 
468 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.497934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4639  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.14 
 
 
351 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000215932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.27 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  19.22 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.69 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  25.74 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4824  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  36.63 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  25.74 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12920  taurine ABC transporter periplasmic protein  26.77 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.472759  normal  0.43236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3606  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  37.14 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1169  taurine ABC transporter periplasmic binding protein  25.75 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.845076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  27.11 
 
 
345 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5011  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  24.79 
 
 
468 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  26.97 
 
 
319 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0350  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  35.64 
 
 
311 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>