75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0818 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1878  ABC transporter substrate binding protein  100 
 
 		 348 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1866  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 348 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346438  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0818  ABC transporter substrate binding protein  100 
 
 		 348 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0343  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 348 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2032  ABC transporter substrate binding protein  100 
 
 		 348 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1687  ABC transporter substrate binding protein  100 
 
 		 348 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  73.55 
 
 		 350 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3603  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  74.64 
 
 		 350 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2170  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  72.65 
 
 		 350 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4137  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  70.4 
 
 		 341 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1244  ABC transporter substrate binding protein  76.01 
 
 		 343 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6588  ABC transporter substrate binding protein  76.01 
 
 		 343 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6192  ABC transporter substrate binding protein  76.01 
 
 		 343 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6250  ABC transporter substrate binding protein  74.85 
 
 		 351 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6535  ABC transporter substrate binding protein  76.43 
 
 		 351 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6049  ABC transporter substrate binding protein  76.43 
 
 		 351 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0512  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  67.35 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34770  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  67.57 
 
 		 340 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.0167014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0138  NLPA lipoprotein  67.08 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2677  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  64.71 
 
 		 343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0191  ABC transporter periplasmic-binding protein  63.82 
 
 		 339 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0170  ABC transporter, periplasmic binding protein  63.53 
 
 		 339 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5057  ABC transporter, periplasmic binding protein  63.82 
 
 		 339 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  65.62 
 
 		 345 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00383664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0189  ABC transporter, periplasmic binding protein  63.82 
 
 		 339 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30920  ABC transporter, periplasmic binding protein  62.74 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3450  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  66.45 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302208  hitchhiker  0.000774086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5195  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.1 
 
 		 339 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0340  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.19 
 
 		 339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4888  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  49.4 
 
 		 332 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal  0.144986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2205  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.16 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1388  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.84 
 
 		 317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30880  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.1 
 
 		 339 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1797  ABC transporter periplasmic binding protein  49.24 
 
 		 340 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1399  ABC transporter periplasmic binding protein  48.93 
 
 		 341 aa  335  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3455  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  48.69 
 
 		 347 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1299  ABC transporter periplasmic binding protein  50.64 
 
 		 362 aa  327  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1728  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  44.65 
 
 		 333 aa  279  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1120  ABC transporter, periplasmic binding protein  39.31 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5990  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.85 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.626097 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3152  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.99 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3889  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.68 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  0.125658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4505  NLPA lipoprotein  41.67 
 
 		 342 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.826664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5060  ABC transporter substrate-binding protein  38.48 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3151  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.73 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3888  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.4 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.37 
 
 		 334 aa  232  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_003296  RS03032  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  38.17 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.08661 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6244  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  38.18 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4009  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  38.29 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4122  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  38.29 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0536  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  37.54 
 
 		 342 aa  222  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00532956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  35.62 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1606  NLPA lipoprotein  38.33 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000297803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6690  putative periplasmic substrate-binding subunit (ABC transporter)  35.88 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  35.95 
 
 		 338 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2525  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.85 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74884  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3590  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.01 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3930  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.68 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3259  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  34.74 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3496  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.67 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5326  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.33 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  24.11 
 
 		 349 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5095  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.36 
 
 		 119 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.296668  normal  0.288347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  26.42 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  26.42 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1211  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.95 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  27.93 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  25.77 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.51 
 
 		 333 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.31 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4331  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.15 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 347 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>