158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0553 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
133 aa  269  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  66.4 
 
 
133 aa  187  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  69.6 
 
 
130 aa  183  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  67.74 
 
 
131 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  64.23 
 
 
132 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  67.74 
 
 
131 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  64.8 
 
 
132 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  64.8 
 
 
132 aa  176  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  66.67 
 
 
132 aa  176  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  60.77 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  60.8 
 
 
131 aa  167  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  60.63 
 
 
163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  61.42 
 
 
134 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  61.42 
 
 
143 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  59.84 
 
 
134 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  59.84 
 
 
134 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  61.42 
 
 
134 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  61.42 
 
 
134 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  61.42 
 
 
134 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  61.42 
 
 
134 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  61.42 
 
 
134 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  59.84 
 
 
134 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  60.63 
 
 
139 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  61.42 
 
 
134 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  59.84 
 
 
134 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  59.84 
 
 
134 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  57.39 
 
 
121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  50 
 
 
137 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0115  dihydroneopterin aldolase  44.17 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379308  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  40.87 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  39.67 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  39.29 
 
 
396 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  38.61 
 
 
272 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
130 aa  58.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  27.78 
 
 
123 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  28.71 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  29.63 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3078  dihydroneopterin aldolase  32.73 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  33.9 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  34.92 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  28.71 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0774  dihydroneopterin aldolase  42.48 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349687  normal  0.309936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0794  dihydroneopterin aldolase  29.73 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.19787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  34.78 
 
 
311 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  37.84 
 
 
397 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 
283 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  33.91 
 
 
300 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  36.27 
 
 
126 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  33.91 
 
 
300 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.66 
 
 
291 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  25.45 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  33.96 
 
 
306 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03450  dihydroneopterin aldolase FolB, putative  28.83 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  37 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  26.13 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1000  dihydroneopterin aldolase, putative  33.93 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  25.93 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 
117 aa  48.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  32.46 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2692  dihydroneopterin aldolase  27.93 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00414447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  29.09 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  34 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0828  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0052  putative dihydroneopterin aldolase FolB  27.52 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148451  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  35.51 
 
 
333 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0894  putative dihydroneopterin aldolase  33.93 
 
 
153 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0391  dihydroneopterin aldolase, putative  33.93 
 
 
153 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  24.07 
 
 
124 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0487  putative dihydroneopterin aldolase  33.93 
 
 
153 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0163  putative dihydroneopterin aldolase  33.93 
 
 
153 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1447  putative dihydroneopterin aldolase  33.93 
 
 
153 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1105  putative dihydroneopterin aldolase protein  32.14 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0652019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3460  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.7 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.125867 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3392  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.7 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000166659  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3562  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.7 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0891124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3396  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.7 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166332  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1950  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373472  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1858  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3466  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.7 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  26.13 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  26.13 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4370  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516062  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  25.44 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  28.95 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0642  dihydroneopterin aldolase  27.78 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0062144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0639  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  25.93 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00488961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0298  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  25.93 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00167375  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0663  dihydroneopterin aldolase  32.17 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3489  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.78 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1246  dihydroneopterin aldolase  30.63 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0419783  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0558  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  25.93 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0641  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.78 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000115743  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3236  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.78 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3521  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  27.78 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.316969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>