139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0205 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 131 aa  269  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  99.24 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  86.92 
 
 		 130 aa  235  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  74.81 
 
 		 133 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  75.38 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  74.81 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  74.22 
 
 		 132 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  74.6 
 
 		 130 aa  207  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  71.54 
 
 		 131 aa  206  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  71.32 
 
 		 132 aa  204  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  72.52 
 
 		 139 aa  203  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  71.76 
 
 		 134 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  71.76 
 
 		 143 aa  201  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  71.76 
 
 		 134 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  71.76 
 
 		 134 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  71.76 
 
 		 134 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  71.76 
 
 		 134 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  71.76 
 
 		 134 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  70.99 
 
 		 134 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  70.99 
 
 		 134 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  70.99 
 
 		 134 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  70.99 
 
 		 163 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  71.76 
 
 		 134 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  69.47 
 
 		 134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  69.47 
 
 		 134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  67.74 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  69.03 
 
 		 121 aa  177  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  44.53 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0115  dihydroneopterin aldolase  43.36 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  39.32 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  39.02 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  34.38 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.51 
 
 		 291 aa  60.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0774  dihydroneopterin aldolase  38.39 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349687  normal  0.309936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  33.66 
 
 		 396 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  32.67 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 283 aa  53.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  29.81 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  26.72 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  26.67 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  28.95 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3163  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.19 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3078  dihydroneopterin aldolase  25.89 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0423  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3146  dihydroneopterin aldolase  25.81 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  24.78 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0392  dihydroneopterin aldolase  28.95 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  24.78 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  26.42 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  23.21 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1300  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  32.76 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  27.88 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 		 311 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0426  dihydroneopterin aldolase  28.95 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  27.93 
 
 		 130 aa  47.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  30.4 
 
 		 306 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0052  putative dihydroneopterin aldolase FolB  24.35 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4810  dihydroneopterin aldolase  28.95 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.579174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  23.28 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19620  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.5 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 397 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  29.09 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  34.88 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  26.92 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02300  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.09 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.52127  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2438  dihydroneopterin aldolase  24.14 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 		 272 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1046  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0337595  normal  0.538227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4345  dihydroneopterin aldolase  31.96 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  23.01 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5144  dihydroneopterin aldolase family protein  27.19 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  24.35 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4023  dihydroneopterin aldolase  27.35 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  25.86 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1689  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  25.64 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03450  dihydroneopterin aldolase FolB, putative  25.66 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  23.01 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  23.01 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  25.44 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2910  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.5 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  23.01 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5132  dihydroneopterin aldolase  30.08 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.659907  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3508  dihydroneopterin aldolase  27.82 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  31.96 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2988  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3220  dihydroneopterin aldolase  30.08 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5147  dihydroneopterin aldolase  30.08 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  23.89 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>