185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2277 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 135 aa  266  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  55.2 
 
 		 139 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  50 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4345  dihydroneopterin aldolase  44.78 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  46.61 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  43.75 
 
 		 396 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  45.13 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2990  dihydroneopterin aldolase  41.96 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.472635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  37.72 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  36.84 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  36.84 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  36.84 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  38.74 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  37.5 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0534  dihydroneopterin aldolase  35.14 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  38.39 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  36.28 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  36.28 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  36.28 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  36.28 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0829  dihydroneopterin aldolase  34.82 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000184652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  35.71 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2063  dihydroneopterin aldolase  34.23 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.424168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  35.65 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  33.05 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  36.21 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5144  dihydroneopterin aldolase family protein  36.52 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4810  dihydroneopterin aldolase  35.4 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.579174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2828  dihydroneopterin aldolase  36.28 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0032531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1110  dihydroneopterin aldolase  35.09 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0294457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0423  dihydroneopterin aldolase  34.51 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4023  dihydroneopterin aldolase  34.51 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  36.59 
 
 		 300 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  36.59 
 
 		 300 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  36.59 
 
 		 311 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0392  dihydroneopterin aldolase  33.63 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0426  dihydroneopterin aldolase  33.63 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1002  dihydroneopterin aldolase  30.63 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  32.43 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  29.73 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  31.03 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  31.03 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  31.9 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0039  dihydroneopterin aldolase family protein  33.33 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0542  dihydroneopterin aldolase  35.71 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4636  dihydroneopterin aldolase  34.82 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  33.9 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  30.36 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  34.51 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  34.23 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  34.21 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  27.03 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2381  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0193  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.600595  normal  0.861328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07590  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0294524 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2692  dihydroneopterin aldolase  34.23 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00414447  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  27.93 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  27.93 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  33.05 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  36.89 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0329  dihydroneopterin aldolase  32.46 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  31.43 
 
 		 272 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 		 306 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  34.21 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0828  dihydroneopterin aldolase  31.53 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  28.93 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  34.44 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0794  dihydroneopterin aldolase  30.63 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.19787  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  34.04 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1182  dihydroneopterin aldolase  28.45 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04103  dihydroneopterin aldolase  31.86 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1246  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0419783  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0723  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  25.23 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  34.04 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>