78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4088 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
123 aa  250  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  88.62 
 
 
123 aa  221  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  88.62 
 
 
150 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  85.37 
 
 
123 aa  217  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  89.83 
 
 
130 aa  214  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  84.3 
 
 
130 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  84.55 
 
 
125 aa  207  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  81.3 
 
 
123 aa  205  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  81.82 
 
 
124 aa  205  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  29.63 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  31.86 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  32.08 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  30.11 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  30.11 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  32.08 
 
 
117 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  25.96 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  27.66 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  31 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  31 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  31 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  29.36 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  29.03 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  29.59 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 
300 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 
311 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1246  dihydroneopterin aldolase  27.27 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0419783  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 
300 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  32.29 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  27.66 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  32.26 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  29.91 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  28.85 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  29.09 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 
124 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  29.09 
 
 
131 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 
143 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.73 
 
 
612 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  34.78 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  27.78 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  28.72 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  32.93 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  28.32 
 
 
525 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  33.68 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  26.67 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0534  dihydroneopterin aldolase  31.63 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.29 
 
 
841 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  32.69 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  30.83 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2988  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  27.97 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 
470 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0039  dihydroneopterin aldolase family protein  28.87 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  30.61 
 
 
312 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  26.79 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  38.6 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  26.8 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04103  dihydroneopterin aldolase  28.12 
 
 
115 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  30.3 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0193  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.600595  normal  0.861328 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6489  dihydroneopterin aldolase  32.38 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal  0.299882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>