108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2728 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  100 
 
 
312 aa  612  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  58.42 
 
 
300 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  58.42 
 
 
300 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  57.73 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  54.51 
 
 
306 aa  297  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  55.24 
 
 
283 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  43.41 
 
 
272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  39.64 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.65 
 
 
612 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  34.94 
 
 
124 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  37.7 
 
 
143 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  32.56 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.94 
 
 
1211 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1182  dihydroneopterin aldolase  32.35 
 
 
140 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  36.17 
 
 
147 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0619  dihydroneopterin aldolase  39.76 
 
 
128 aa  52.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  31.07 
 
 
140 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1246  dihydroneopterin aldolase  29.66 
 
 
127 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0419783  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  31.07 
 
 
128 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  34.02 
 
 
525 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.59 
 
 
841 aa  50.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.94 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 
116 aa  49.7  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4295  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  34.52 
 
 
119 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00183631  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 
130 aa  49.7  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 
116 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 
116 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
134 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  29.7 
 
 
117 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0558  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  32.14 
 
 
119 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0298  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  32.14 
 
 
119 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00167375  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0639  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  32.14 
 
 
119 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00488961  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
134 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.2 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  34.62 
 
 
126 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
134 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
134 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  32.52 
 
 
135 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  38.03 
 
 
145 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
134 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0828  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 
117 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3410  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  35.21 
 
 
117 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0269444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  31.63 
 
 
130 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  35.63 
 
 
133 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0542  dihydroneopterin aldolase  31.33 
 
 
117 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4636  dihydroneopterin aldolase  31.33 
 
 
117 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  29.81 
 
 
116 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  36.67 
 
 
137 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.8 
 
 
213 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0126  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
119 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280632  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0126  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
119 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  31.73 
 
 
139 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  29.59 
 
 
123 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 
116 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3461  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  32.14 
 
 
122 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00080396  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 
116 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 
116 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 
116 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3569  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  33.8 
 
 
117 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  30.25 
 
 
163 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2063  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
119 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.424168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0423  dihydroneopterin aldolase  28.45 
 
 
118 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248997  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4810  dihydroneopterin aldolase  28.45 
 
 
118 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.579174  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  33.73 
 
 
135 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  34.34 
 
 
126 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5144  dihydroneopterin aldolase family protein  27.59 
 
 
118 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0774  dihydroneopterin aldolase  36.49 
 
 
133 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349687  normal  0.309936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0829  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000184652  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1046  dihydroneopterin aldolase  36.62 
 
 
121 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0337595  normal  0.538227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 
117 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  29.59 
 
 
123 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 
117 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0392  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 
118 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19882  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0426  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 
118 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285711  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  27.03 
 
 
118 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  33.68 
 
 
120 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  28.92 
 
 
117 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  31.36 
 
 
124 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  30.12 
 
 
123 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1002  dihydroneopterin aldolase  26.32 
 
 
117 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00980814  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04103  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
115 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0329  dihydroneopterin aldolase  30.12 
 
 
117 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.83425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0705  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  35.35 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0794  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.19787  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 
134 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0534  dihydroneopterin aldolase  29.21 
 
 
116 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  34.31 
 
 
121 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  34.31 
 
 
121 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
134 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  25.42 
 
 
132 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  34.72 
 
 
117 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
143 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  32.94 
 
 
128 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  30.99 
 
 
131 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  32.56 
 
 
127 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.53 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 
132 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
139 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
134 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
134 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>