100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2399 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 283 aa  551  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  60 
 
 		 300 aa  294  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  60 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  55.24 
 
 		 312 aa  288  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  59.65 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  54.09 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  44.31 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  39.64 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  39.64 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  38.39 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 		 163 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  36.89 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  37.93 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  34.68 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  31.11 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  31.36 
 
 		 132 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  33.06 
 
 		 132 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  31.03 
 
 		 132 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 131 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 131 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  31.86 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 		 133 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 		 132 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 139 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 143 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29 
 
 		 841 aa  52.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 134 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  31.86 
 
 		 126 aa  52.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 134 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 134 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 134 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 134 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 134 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0619  dihydroneopterin aldolase  37.21 
 
 		 128 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  28.09 
 
 		 117 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 		 121 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 		 130 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.99 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  28.09 
 
 		 117 aa  50.4  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 		 116 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 		 116 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4345  dihydroneopterin aldolase  32.29 
 
 		 143 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 		 116 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  28.95 
 
 		 116 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19620  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.63 
 
 		 123 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  29.36 
 
 		 117 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  36.71 
 
 		 118 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2438  dihydroneopterin aldolase  28.8 
 
 		 139 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3290  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.63 
 
 		 123 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1689  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.73 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10260  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  33.04 
 
 		 125 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0542  dihydroneopterin aldolase  26.8 
 
 		 117 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  24.17 
 
 		 121 aa  45.8  0.0008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 		 117 aa  45.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  30.93 
 
 		 155 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  34.34 
 
 		 126 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0254  amino acid kinase family protein  32.91 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 117 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2063  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.424168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  33.72 
 
 		 128 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.37 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0890  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  32.14 
 
 		 123 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  27.38 
 
 		 123 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 		 117 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 		 117 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2457  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  33.33 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330903  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 		 116 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  28.28 
 
 		 128 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  28.74 
 
 		 118 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  34.12 
 
 		 135 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4636  dihydroneopterin aldolase  28.24 
 
 		 117 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 		 116 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 		 116 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  25.44 
 
 		 119 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 		 116 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1182  dihydroneopterin aldolase  23.77 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  29.9 
 
 		 127 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  30.93 
 
 		 120 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1489  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  34.62 
 
 		 122 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.52 
 
 		 612 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5144  dihydroneopterin aldolase family protein  27.19 
 
 		 118 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1019  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  33.04 
 
 		 123 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  23.08 
 
 		 140 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 		 117 aa  43.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0329  dihydroneopterin aldolase  28.07 
 
 		 117 aa  42.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83425 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  31.62 
 
 		 121 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2852  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.91 
 
 		 120 aa  42.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.329943  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  31.62 
 
 		 121 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2828  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 		 117 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0032531  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0126  dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 		 119 aa  42  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0126  dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 		 119 aa  42  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>