32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0254 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0254  amino acid kinase family protein  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2457  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  39.34 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330903  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2619  uncharacterized kinase  40.57 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0138067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1647  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.33 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000510531  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2871  amino acid kinase family protein  41.09 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6500  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.62 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0428834 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5938  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  37.22 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.0234178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5016  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.01 
 
 		 190 aa  124  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.761647  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1794  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.35 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.77 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4102  amino acid kinase family protein  39.79 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5320  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.2 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3140  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40 
 
 		 197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2178  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.12 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1843  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.12 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2724  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.76 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0179  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.96 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000583538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.26 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0644  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.36 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0413219  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1274  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.83 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1317  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.88 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3071  aspartokinase uridylate kinase-like putative kinase  45.26 
 
 		 139 aa  84.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0710  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.92 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.155359  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2447  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.02 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2332  Uncharacterized aspartokinase uridylate kinase-like protein  30.39 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0494  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.33 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1384  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.44 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2346  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  29.74 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3438  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  28.57 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0400881 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0839  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.16 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0628  hypothetical protein  34.19 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  32.91 
 
 		 283 aa  45.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>