43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1317 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1317  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
210 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3438  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  50.91 
 
 
221 aa  227  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0400881 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0839  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.31 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1384  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.5 
 
 
220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2447  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.54 
 
 
200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0494  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.81 
 
 
208 aa  132  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104151  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0710  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.87 
 
 
209 aa  131  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.155359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0179  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.33 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000583538  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0644  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.33 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0413219  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.71 
 
 
230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1274  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.86 
 
 
212 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2346  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  35.44 
 
 
191 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0628  hypothetical protein  33.51 
 
 
170 aa  96.3  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0254  amino acid kinase family protein  36.88 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4102  amino acid kinase family protein  29.9 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2332  Uncharacterized aspartokinase uridylate kinase-like protein  36.77 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2871  amino acid kinase family protein  39.86 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1647  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.12 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000510531  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2619  uncharacterized kinase  32.67 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0138067  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2457  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  34.53 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330903  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6500  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.12 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0428834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2724  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.89 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3140  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.21 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5938  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  37.04 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.0234178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1794  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.78 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1843  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.31 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2178  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.91 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.08 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5016  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.34 
 
 
190 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.761647  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5320  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.06 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  25.79 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.94 
 
 
271 aa  49.3  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3071  aspartokinase uridylate kinase-like putative kinase  37.18 
 
 
139 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  28.57 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.12 
 
 
273 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.42 
 
 
276 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  29.03 
 
 
282 aa  45.1  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  29.03 
 
 
282 aa  45.1  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  32.99 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  32.99 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.04 
 
 
277 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  22.17 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.27 
 
 
277 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>