25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3071 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3071  aspartokinase uridylate kinase-like putative kinase  100 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2619  uncharacterized kinase  62.89 
 
 		 202 aa  123  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0138067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3140  aspartate/glutamate/uridylate kinase  60 
 
 		 197 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6500  aspartate/glutamate/uridylate kinase  57.73 
 
 		 196 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0428834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2457  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  54.17 
 
 		 196 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330903  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5938  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  52.58 
 
 		 196 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.0234178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0254  amino acid kinase family protein  45.26 
 
 		 202 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2871  amino acid kinase family protein  49.48 
 
 		 197 aa  84.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1647  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.96 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000510531  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4102  amino acid kinase family protein  43.16 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2724  aspartate/glutamate/uridylate kinase  48.15 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1794  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5016  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.86 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.761647  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1843  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.58 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2178  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.62 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0839  aspartate/glutamate/uridylate kinase  48 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1317  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.18 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3438  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  34.38 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0400881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.14 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1274  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.94 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0644  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.81 
 
 		 212 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0413219  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0179  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.38 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000583538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5320  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.67 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0710  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.85 
 
 		 209 aa  42.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.155359  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2447  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.46 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>