32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6500 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6500  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0428834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2457  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  76.56 
 
 
196 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330903  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5938  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  54.12 
 
 
196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.0234178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2619  uncharacterized kinase  49.48 
 
 
202 aa  204  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0138067  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3140  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.56 
 
 
197 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0254  amino acid kinase family protein  38.62 
 
 
202 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2871  amino acid kinase family protein  43.18 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1647  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.95 
 
 
209 aa  122  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000510531  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3071  aspartokinase uridylate kinase-like putative kinase  57.73 
 
 
139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.3 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2724  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.2 
 
 
191 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1794  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.59 
 
 
213 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5016  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.89 
 
 
190 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.761647  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2178  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.7 
 
 
204 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4102  amino acid kinase family protein  39.53 
 
 
215 aa  101  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1843  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.55 
 
 
204 aa  99  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5320  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.77 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2332  Uncharacterized aspartokinase uridylate kinase-like protein  29.61 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0179  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.06 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000583538  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1317  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.12 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3438  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  36.49 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0400881 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0710  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.78 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.155359  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1274  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.78 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0644  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.59 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0413219  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0494  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.33 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104151  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1384  aspartate/glutamate/uridylate kinase  23.88 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2447  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.33 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0628  hypothetical protein  32.73 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2346  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  29.1 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0839  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.57 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.57 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  36.26 
 
 
300 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>