37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2395 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 213 aa  410  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0254  amino acid kinase family protein  42.77 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1794  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.31 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5016  aspartate/glutamate/uridylate kinase  47.51 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.761647  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1647  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.22 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000510531  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2178  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.81 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6500  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.3 
 
 		 196 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0428834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1843  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.98 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2457  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  36.7 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330903  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5938  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  42.14 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.0234178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5320  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.32 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2724  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.66 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4102  amino acid kinase family protein  39.89 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2871  amino acid kinase family protein  37.72 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2619  uncharacterized kinase  34.41 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0138067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3140  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.88 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0644  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.22 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0413219  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0710  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.85 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.155359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.8 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0179  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.22 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000583538  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1274  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.94 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0494  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.15 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2332  Uncharacterized aspartokinase uridylate kinase-like protein  31.77 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1317  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.76 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3438  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  33.62 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0400881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0628  hypothetical protein  33.14 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1384  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.1 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2447  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.44 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3071  aspartokinase uridylate kinase-like putative kinase  38.14 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2346  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  27.12 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  30.23 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  41.49 
 
 		 300 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0839  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.9 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  40.43 
 
 		 300 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  40.74 
 
 		 311 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  35.8 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  35.44 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>