84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2307 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  63.46 
 
 		 300 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  63.12 
 
 		 300 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  62.46 
 
 		 311 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  54.51 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  54.09 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  43.41 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  40.54 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  36.75 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  36.97 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  34.68 
 
 		 143 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 		 134 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 		 134 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 		 134 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 		 134 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 		 134 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 		 134 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  31.36 
 
 		 132 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  30.95 
 
 		 131 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  35.29 
 
 		 133 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.96 
 
 		 213 aa  52.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  31.97 
 
 		 132 aa  52.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 132 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  31.62 
 
 		 130 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  31.94 
 
 		 145 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.05 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  32.85 
 
 		 137 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  29.66 
 
 		 130 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  33.96 
 
 		 133 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  31.45 
 
 		 133 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  30.25 
 
 		 126 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  34.78 
 
 		 397 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  30.6 
 
 		 132 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  30.4 
 
 		 131 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  27.27 
 
 		 121 aa  47.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  30.4 
 
 		 131 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  32.43 
 
 		 121 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  30.95 
 
 		 117 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  30.7 
 
 		 117 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  28.87 
 
 		 123 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  30.95 
 
 		 117 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.99 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  27.19 
 
 		 119 aa  45.8  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  31.76 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0558  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.95 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0298  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.95 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00167375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0639  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.95 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00488961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0794  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 		 120 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.19787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  29.25 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10260  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.7 
 
 		 125 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3410  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.95 
 
 		 117 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0269444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  31.76 
 
 		 119 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3569  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.76 
 
 		 117 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2063  dihydroneopterin aldolase  29.31 
 
 		 119 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.424168  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.65 
 
 		 612 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1246  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 127 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0419783  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 		 130 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2692  dihydroneopterin aldolase  27.38 
 
 		 117 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00414447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0890  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.41 
 
 		 123 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  25.21 
 
 		 123 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4295  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.76 
 
 		 119 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00183631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  28.89 
 
 		 123 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  38.6 
 
 		 123 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 126 aa  42.7  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  31.46 
 
 		 131 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1182  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 140 aa  42.7  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0039  dihydroneopterin aldolase family protein  26.13 
 
 		 125 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4636  dihydroneopterin aldolase  31.4 
 
 		 117 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 		 116 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5144  dihydroneopterin aldolase family protein  29.31 
 
 		 118 aa  42.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  29.25 
 
 		 155 aa  42.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 		 116 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 		 116 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 		 116 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>