89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1709 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 121 aa  250  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  89.57 
 
 		 131 aa  220  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  69.3 
 
 		 132 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  68.7 
 
 		 132 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  69.03 
 
 		 132 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  69.91 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  69.03 
 
 		 131 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  67.26 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  65.22 
 
 		 133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  64.6 
 
 		 130 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  64.35 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 143 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  58.41 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  57.39 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  55.75 
 
 		 134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  55.75 
 
 		 134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  43.75 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  42.34 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0115  dihydroneopterin aldolase  37.96 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  35.83 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  32.43 
 
 		 397 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0774  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349687  normal  0.309936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  34.51 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  29.79 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  30.11 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 		 283 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  29.03 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  29.79 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2692  dihydroneopterin aldolase  24.78 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00414447  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  27.96 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  27.96 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 		 311 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  27.96 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  29.31 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  24.37 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  24.35 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  32.43 
 
 		 306 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  29.03 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  24.37 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3078  dihydroneopterin aldolase  27.03 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  23.01 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  26.32 
 
 		 291 aa  45.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  25.81 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  25.23 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1858  dihydroneopterin aldolase  27.93 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2438  dihydroneopterin aldolase  21.55 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5144  dihydroneopterin aldolase family protein  30.7 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  30.84 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0828  dihydroneopterin aldolase  19.47 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  23.42 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  27.72 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  31.11 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  26.13 
 
 		 117 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1447  putative dihydroneopterin aldolase  27.03 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0052  putative dihydroneopterin aldolase FolB  23.28 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148451  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0487  putative dihydroneopterin aldolase  27.03 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0163  putative dihydroneopterin aldolase  27.03 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1046  dihydroneopterin aldolase  26.79 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0337595  normal  0.538227 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0391  dihydroneopterin aldolase, putative  27.03 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0894  putative dihydroneopterin aldolase  27.03 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1950  dihydroneopterin aldolase  27.03 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373472  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  27.03 
 
 		 272 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  23.42 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4810  dihydroneopterin aldolase  28.95 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.579174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1000  dihydroneopterin aldolase, putative  26.13 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0423  dihydroneopterin aldolase  28.95 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3146  dihydroneopterin aldolase  23.68 
 
 		 176 aa  40  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  29.67 
 
 		 120 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>