198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2219 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  100 
 
 		 139 aa  275  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  55.2 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  59.06 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  53.78 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  42.98 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  42.34 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  41.38 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  41.38 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  42.24 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  40.17 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  47.41 
 
 		 397 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  42.86 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  39.32 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  39.32 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  39.06 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  40.87 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4345  dihydroneopterin aldolase  45.19 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  36.72 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  39.1 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  39.1 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  39.1 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  39.64 
 
 		 283 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  40.54 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  36.36 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  36.36 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  36.36 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  35.61 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  36.8 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  36.8 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  36.8 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  36.8 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  36.8 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  36.8 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  36.8 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  36.8 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0039  dihydroneopterin aldolase family protein  30.17 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2990  dihydroneopterin aldolase  33.91 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.472635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  36.28 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0829  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000184652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  36.43 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  38.02 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  38.02 
 
 		 300 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  38.02 
 
 		 311 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0894  putative dihydroneopterin aldolase  34.11 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0391  dihydroneopterin aldolase, putative  34.11 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0487  putative dihydroneopterin aldolase  34.11 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0163  putative dihydroneopterin aldolase  34.11 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  30.63 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1447  putative dihydroneopterin aldolase  34.11 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0534  dihydroneopterin aldolase  34.23 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  36.75 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1950  dihydroneopterin aldolase  34.11 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373472  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1000  dihydroneopterin aldolase, putative  35.71 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  28.07 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  30.63 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.17 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2063  dihydroneopterin aldolase  27.93 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.424168  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0050  dihydroneopterin aldolase protein  33.93 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.333403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4826  dihydroneopterin aldolase  33.93 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  27.93 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1858  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3329  dihydroneopterin aldolase  33.05 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1105  putative dihydroneopterin aldolase protein  33.04 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0652019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0126  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5144  dihydroneopterin aldolase family protein  31.62 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0126  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  30.7 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1110  dihydroneopterin aldolase  32.46 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0294457  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5132  dihydroneopterin aldolase  34.11 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.659907  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3508  dihydroneopterin aldolase  31.01 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  27.93 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0329  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3220  dihydroneopterin aldolase  34.11 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5147  dihydroneopterin aldolase  34.11 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  31.62 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5065  dihydroneopterin aldolase  32.56 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4636  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0423  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2828  dihydroneopterin aldolase  28.07 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0032531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4810  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.579174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1002  dihydroneopterin aldolase  27.19 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4542  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07590  dihydroneopterin aldolase  34.51 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0294524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0392  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0426  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0490  dihydroneopterin aldolase  31.01 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>