135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1861 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 300 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  99.33 
 
 		 300 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  96.33 
 
 		 311 aa  553  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  63.46 
 
 		 306 aa  348  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  58.42 
 
 		 312 aa  311  9e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  60 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  44.18 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  40.98 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  37.7 
 
 		 143 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 		 134 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 		 134 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  36.59 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  38.02 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  38.52 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 134 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 134 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 134 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 134 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 134 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 134 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  34.33 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  28.81 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  32.23 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  31.3 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.09 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  34.44 
 
 		 145 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 		 130 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  31.68 
 
 		 124 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  28.7 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  31.11 
 
 		 123 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  31.62 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 123 aa  53.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  31.73 
 
 		 117 aa  52.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  33.91 
 
 		 133 aa  52.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  31.97 
 
 		 124 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 126 aa  52.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 116 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.43 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5144  dihydroneopterin aldolase family protein  30.43 
 
 		 118 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  31.11 
 
 		 130 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 132 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.33 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  29.91 
 
 		 131 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  35.35 
 
 		 126 aa  50.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 		 133 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  30.7 
 
 		 117 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 117 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.65 
 
 		 333 aa  49.7  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0542  dihydroneopterin aldolase  28.87 
 
 		 117 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0534  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 116 aa  49.7  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4636  dihydroneopterin aldolase  31.76 
 
 		 117 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 116 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 116 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 116 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 116 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 116 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 116 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  35.05 
 
 		 525 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 		 155 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 		 123 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  33.01 
 
 		 117 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 116 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  30.68 
 
 		 123 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  34.02 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 117 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  31.76 
 
 		 118 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.32 
 
 		 612 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  25.83 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  28.89 
 
 		 125 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  32.61 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.36 
 
 		 1211 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  27.71 
 
 		 123 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0423  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 118 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4810  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 118 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.579174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0392  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 118 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  24.17 
 
 		 121 aa  47  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04103  dihydroneopterin aldolase  32.04 
 
 		 115 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0426  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 118 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4295  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  31.18 
 
 		 119 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00183631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1246  dihydroneopterin aldolase  29.29 
 
 		 127 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0419783  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.59 
 
 		 841 aa  46.2  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  27.1 
 
 		 120 aa  45.8  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.71 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0558  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.35 
 
 		 119 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172177  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 		 117 aa  45.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0298  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.35 
 
 		 119 aa  45.8  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00167375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0639  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.35 
 
 		 119 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00488961  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 		 123 aa  45.8  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  28.23 
 
 		 131 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>