279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2891 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
126 aa  248  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  66.95 
 
 
120 aa  154  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  64.96 
 
 
310 aa  151  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  66.09 
 
 
120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  65.25 
 
 
124 aa  150  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  65.22 
 
 
120 aa  150  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  59.32 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  60 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  59.83 
 
 
123 aa  140  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  61.34 
 
 
337 aa  138  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  58.47 
 
 
127 aa  137  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  59.66 
 
 
137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  58.62 
 
 
333 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  59.32 
 
 
155 aa  130  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  54.24 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  56.41 
 
 
841 aa  127  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  56.3 
 
 
612 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  54.62 
 
 
1211 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  52.54 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  55.46 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  52.99 
 
 
123 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  52 
 
 
125 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  51.69 
 
 
119 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  54.05 
 
 
125 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  55.93 
 
 
525 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  54.05 
 
 
125 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  53.33 
 
 
470 aa  118  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0619  dihydroneopterin aldolase  60.17 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3443  dihydroneopterin aldolase  62.71 
 
 
135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.996393  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4014  dihydroneopterin aldolase  56.41 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  52.21 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5369  dihydroneopterin aldolase  52.1 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  51.24 
 
 
144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1419  dihydroneopterin aldolase  52.14 
 
 
123 aa  105  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0705  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  50 
 
 
372 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  48.31 
 
 
125 aa  102  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24750  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  49.14 
 
 
295 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  44.54 
 
 
305 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0851  dihydroneopterin aldolase  51.3 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  40.68 
 
 
131 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  44.07 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  46.61 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  39.32 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  42.37 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  41.88 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  41.03 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  42.02 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  40.52 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  40.52 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  41.53 
 
 
122 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  39.83 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  40.68 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  41.53 
 
 
125 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  43.7 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  39.32 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1277  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  39.32 
 
 
273 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00023315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  34.92 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1099  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  39.32 
 
 
273 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00662254  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  36.67 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  42.48 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  42.42 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  40.74 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  36.97 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.75 
 
 
276 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  37.5 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  36.63 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  36.13 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  37.82 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  39.83 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  36.63 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  38.66 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  36.63 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  36.63 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  36.63 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  35.64 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  35.64 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  40.68 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2988  dihydroneopterin aldolase  36.73 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  34.75 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  32.11 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  39.29 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  34.75 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  34.65 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  34.65 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>