106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0520 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
143 aa  293  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  98.56 
 
 
139 aa  281  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  91.37 
 
 
163 aa  261  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  91.79 
 
 
134 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  90.3 
 
 
134 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  90.3 
 
 
134 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  88.81 
 
 
134 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  88.72 
 
 
134 aa  245  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  88.72 
 
 
134 aa  245  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  73.08 
 
 
130 aa  202  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  71.76 
 
 
131 aa  202  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  71.76 
 
 
131 aa  201  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  68.46 
 
 
133 aa  193  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  68.75 
 
 
132 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  69.05 
 
 
130 aa  185  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  62.79 
 
 
132 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  62.6 
 
 
132 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  62.31 
 
 
132 aa  180  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  60.47 
 
 
131 aa  174  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  61.42 
 
 
133 aa  160  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 
121 aa  149  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  48 
 
 
137 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0115  dihydroneopterin aldolase  36.67 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379308  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  37.69 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  36.8 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  38.79 
 
 
396 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  37.4 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 
300 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 
300 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 
311 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.51 
 
 
291 aa  57.4  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 
306 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  35.96 
 
 
272 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  41.75 
 
 
397 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  34.65 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 
283 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  25.22 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
123 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  31.68 
 
 
134 aa  50.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  29.1 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  28.45 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3078  dihydroneopterin aldolase  30.56 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 
123 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 
123 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  28.45 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 
116 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1046  dihydroneopterin aldolase  31.37 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0337595  normal  0.538227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  25 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  33.06 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  24.56 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  22.32 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0052  putative dihydroneopterin aldolase FolB  23.89 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  26.32 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  23.89 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  22.12 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2438  dihydroneopterin aldolase  25.86 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  35.16 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  24.56 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0663  dihydroneopterin aldolase  26.73 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  33 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2988  dihydroneopterin aldolase  25.89 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2828  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0032531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  28.42 
 
 
125 aa  43.5  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  29.41 
 
 
312 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  29.7 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  31 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2692  dihydroneopterin aldolase  25.22 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00414447  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2011  hypothetical protein  30.19 
 
 
112 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2006  hypothetical protein  30.19 
 
 
112 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2990  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 
117 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.472635  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4345  dihydroneopterin aldolase  32.99 
 
 
143 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3146  dihydroneopterin aldolase  26.19 
 
 
176 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  36.78 
 
 
525 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0039  dihydroneopterin aldolase family protein  23.21 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>