176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0507 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
137 aa  276  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  45.8 
 
 
132 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  47.9 
 
 
132 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  47.9 
 
 
132 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  48.72 
 
 
133 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  44.53 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  47.2 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  44.53 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  48.21 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  46.72 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  50 
 
 
133 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  47.01 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  45.19 
 
 
139 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  48 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  48 
 
 
143 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  48 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  48 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  48 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  48 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  48 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  43.75 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  47.2 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  46.4 
 
 
163 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  44.8 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  44.8 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  44.8 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  45.6 
 
 
134 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  45.6 
 
 
134 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0115  dihydroneopterin aldolase  40.65 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379308  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  38.32 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  30.56 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  36.43 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  31.53 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  35.64 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  34.33 
 
 
311 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  34.33 
 
 
300 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  36.89 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  34.33 
 
 
300 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  34.69 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  43.53 
 
 
525 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  30.56 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  40.7 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  30.56 
 
 
123 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1046  dihydroneopterin aldolase  28.71 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0337595  normal  0.538227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  28.04 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  29.63 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  28.04 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  28.04 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 
119 aa  52  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  28.97 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  35.35 
 
 
396 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2011  hypothetical protein  30.28 
 
 
112 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2006  hypothetical protein  30.28 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 
116 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  31.07 
 
 
119 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  30.48 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 
116 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 
116 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 
116 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  32.85 
 
 
306 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  41.38 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  28.87 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0774  dihydroneopterin aldolase  40.2 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349687  normal  0.309936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  28.04 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  29.36 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  35.35 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  29.81 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  33.02 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0663  dihydroneopterin aldolase  29.9 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2692  dihydroneopterin aldolase  30.84 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00414447  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.11 
 
 
291 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  27.88 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  39.56 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  27.78 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 
272 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  28.07 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  24.77 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0298  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.71 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00167375  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0639  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.71 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00488961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  38.78 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0558  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.71 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  34.95 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  34.95 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  26.85 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04103  dihydroneopterin aldolase  29.9 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0329  dihydroneopterin aldolase  29.9 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.83425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  38.37 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  27.19 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03450  dihydroneopterin aldolase FolB, putative  30.1 
 
 
117 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  24.77 
 
 
117 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  37.5 
 
 
124 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 
117 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  27.36 
 
 
124 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  35.71 
 
 
333 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0794  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.19787  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  34.95 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2828  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0032531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3078  dihydroneopterin aldolase  32.35 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>