237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2579 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
126 aa  246  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  62.18 
 
 
127 aa  140  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  47.54 
 
 
131 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  46.4 
 
 
145 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  47.5 
 
 
122 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  53.78 
 
 
124 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  50.48 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  46.72 
 
 
126 aa  99.4  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  44.54 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  52.5 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  42.15 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  43.7 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  41.18 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  42.86 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  41.53 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  42.86 
 
 
122 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  50.51 
 
 
337 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  48.31 
 
 
525 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  44.54 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  42.86 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  44.54 
 
 
470 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  42.86 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  40.68 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  40.68 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  46.22 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  42.02 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  43.8 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  49.49 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  42.5 
 
 
292 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  49.49 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  49.49 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  45.38 
 
 
123 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  46 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  48.54 
 
 
1211 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  43.2 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  36.67 
 
 
276 aa  83.6  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  44.23 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  43.7 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  42.02 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  49.51 
 
 
612 aa  83.2  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  45.54 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  47.9 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  47.9 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  46.22 
 
 
310 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  46.46 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3443  dihydroneopterin aldolase  52.54 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.996393  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  42.72 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  39.5 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  40.95 
 
 
841 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  39.5 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33546  predicted protein  47.47 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183878  hitchhiker  0.00808853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  45.28 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  39.6 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  40.57 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  43.4 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  39.5 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  39.39 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  34.4 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  41.51 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0619  dihydroneopterin aldolase  42.86 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  35.24 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  38.18 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0098  dihydroneopterin aldolase; RBL03201  40.34 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.473342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  36.46 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  38.61 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  39.39 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1277  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  37.93 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00023315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  41.41 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  39 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1099  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  36.78 
 
 
273 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00662254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  41.18 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0329  dihydroneopterin aldolase  36.21 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.83425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  32.5 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  33.66 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  36.19 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  36.19 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  29.29 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  37.37 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5757  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  30.91 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0705  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  42.72 
 
 
372 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  34 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  35.24 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  34 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  36.79 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>