217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0154 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
121 aa  247  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  77.5 
 
 
121 aa  194  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  77.5 
 
 
121 aa  194  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  51.72 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  52.59 
 
 
119 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  45.76 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  44.92 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  47.01 
 
 
120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  44.92 
 
 
120 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  44.92 
 
 
120 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  44.92 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  44.92 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  44.92 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  44.92 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  44.07 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  44.92 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  49.14 
 
 
120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  47.06 
 
 
122 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  42.37 
 
 
131 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  43.33 
 
 
125 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  41.32 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  45.69 
 
 
470 aa  98.6  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  43.7 
 
 
292 aa  97.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  49.14 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  42.86 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  47.41 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  41.18 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  40 
 
 
841 aa  93.2  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  42.5 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  41.53 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  39.66 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
135 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  42.86 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  36.67 
 
 
276 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  45.71 
 
 
117 aa  87.8  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  39.83 
 
 
126 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  42.24 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
130 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  42.86 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  38.66 
 
 
337 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  37.07 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  36.97 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  35.54 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  37.93 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  33.9 
 
 
121 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  38.66 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  41.9 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  40 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  37.93 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  39.83 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  39.29 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  31.4 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  36.21 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  37.82 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  32.5 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  39.39 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33546  predicted protein  33.63 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183878  hitchhiker  0.00808853 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  34.78 
 
 
125 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  38.33 
 
 
128 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  38.79 
 
 
133 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  40 
 
 
310 aa  77  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  38.39 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  36.13 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  31.36 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  39.29 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  35.92 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  32.2 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1675  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0522559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  31.03 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  36.21 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  36.67 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  38.6 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  38.6 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  38.6 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  35.85 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0457  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660964  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0444  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  35.92 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  29.66 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  37.74 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  40.35 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  35.71 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  37.82 
 
 
1211 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  38.46 
 
 
525 aa  71.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  35.4 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  36.75 
 
 
612 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>