150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2568 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 125 aa  259  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  71.77 
 
 		 125 aa  187  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  64.52 
 
 		 125 aa  170  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  61.29 
 
 		 125 aa  167  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  59.68 
 
 		 129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  61.02 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  52.46 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  48.33 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  40.91 
 
 		 119 aa  97.1  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  39.09 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  39.09 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  35.34 
 
 		 118 aa  84.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  41.58 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  36.75 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  35.78 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  39.45 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  42.57 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  41.58 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  30.23 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  37.5 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  40.59 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  36.46 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  30.91 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  32.32 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.46 
 
 		 292 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  41.35 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  37.04 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  30.63 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  29.73 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  34.82 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  34.21 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  40.78 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  38.68 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.14 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  28.28 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  34.65 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  32.67 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  33.66 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  28.71 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  28.71 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  38.24 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  29.73 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  32.35 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  34.31 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  34.31 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  35.24 
 
 		 470 aa  62  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  31.37 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  35.24 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  29.7 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1274  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.436023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  30.48 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03415  FolB  29.13 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  30.39 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  28.43 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5757  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  33.68 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  28.43 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  31.68 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06171  dihydroneopterin aldolase  32.04 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0591  dihydroneopterin aldolase  32.04 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  27.96 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  29.81 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.68 
 
 		 1211 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  33 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  33.7 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  29.66 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  31.82 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  29.75 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0793  dihydroneopterin aldolase  27.52 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000191063  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.58 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.35 
 
 		 310 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.66 
 
 		 333 aa  54.7  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06561  dihydroneopterin aldolase  30.1 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  28 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  28.85 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10591  dihydroneopterin aldolase  30.21 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>