178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1280 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  41.75 
 
 		 118 aa  87  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  33.01 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  38.32 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  30.63 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  32.69 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  35.51 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  34.62 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1274  dihydroneopterin aldolase  38.53 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.436023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  29.73 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  31.86 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  30.84 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  31.86 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  32.65 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  30.56 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.63 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  34.29 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  31.53 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  33.65 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  32.71 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  30.56 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  31.07 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  31.53 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  31.78 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  35.24 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  32.08 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  32.08 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  31.68 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  29.91 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.71 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  30.19 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  31.13 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  30.48 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  33.96 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  31.13 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  30.19 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  30.28 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  28.43 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  30.39 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  32.08 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  28 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  27.62 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  30.56 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  26.67 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  32.65 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  25.71 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  24.07 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  32.08 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  30.11 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  28.04 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  27.62 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  31.13 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5757  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  25.77 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  25.69 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  28.71 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  30.68 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  28.43 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.71 
 
 		 333 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.13 
 
 		 841 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  24.77 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  26.53 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  28.26 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  25.49 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1046  dihydroneopterin aldolase  35.16 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0337595  normal  0.538227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.43 
 
 		 337 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  25.49 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  25.71 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  28.04 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  26.85 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  26.85 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3410  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.74 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0269444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  25.27 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1099  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.77 
 
 		 273 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00662254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 612 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  28.16 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33546  predicted protein  25.89 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183878  hitchhiker  0.00808853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  27.27 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>