112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1274 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1274  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
116 aa  230  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.436023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  37.07 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  38.53 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  35.96 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  37.39 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 
121 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  34.55 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  32.17 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  37.84 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  31.62 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  35.65 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  31.3 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 
131 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.21 
 
 
612 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
120 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
120 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  34.86 
 
 
126 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  34.23 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  31.03 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  34.21 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.86 
 
 
276 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  32.38 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 
120 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  30.36 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  34.51 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  33.63 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  29.81 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  32 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0444  dihydroneopterin aldolase  32.67 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0457  dihydroneopterin aldolase  32.67 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660964  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0027  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  28.04 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  25.64 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  30.17 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06471  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 
129 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.147381  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  30.84 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  28.07 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  25.64 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.3 
 
 
337 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  30.17 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  30.19 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  28.45 
 
 
121 aa  47.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.32 
 
 
292 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  30.17 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 
126 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  32.08 
 
 
123 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 
126 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  32.08 
 
 
125 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  32.08 
 
 
125 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  29.31 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2011  hypothetical protein  34.34 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2006  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  27.36 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  28.83 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  24.78 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0591  dihydroneopterin aldolase  29.25 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  27.96 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4014  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06561  dihydroneopterin aldolase  29.25 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24750  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.43 
 
 
295 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  26.79 
 
 
841 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  27.19 
 
 
525 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6235  dihydroneopterin aldolase  29.25 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.353905  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  27.45 
 
 
155 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>