145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0233 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  100 
 
 
126 aa  261  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  48.33 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  46.83 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  47.54 
 
 
125 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  45.16 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  45.45 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  43.65 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  39.84 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  40 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  39.32 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  37.5 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  34.23 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  40 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  35.59 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  38.6 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  35.45 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  33.63 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  36.94 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  39.81 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  31.86 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03415  FolB  35.9 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
119 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  36.13 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  37.84 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  38.74 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  35.96 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  32.43 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  38.18 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  36.04 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  34.95 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  35.92 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  35.92 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  35.92 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  32.46 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  38.1 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  32.46 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  29.73 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  35.92 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6235  dihydroneopterin aldolase  30.63 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.353905  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  34.78 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  36.94 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  34.58 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  32.04 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.95 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  32.71 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  35.92 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  36.47 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  31.19 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  30.19 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  36.75 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  32.2 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  34.34 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  36.63 
 
 
525 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10591  dihydroneopterin aldolase  26.32 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279574  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  32.35 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  38.46 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  36.27 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  31.68 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  30.1 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.69 
 
 
276 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2328  dihydroneopterin aldolase  26.96 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0793  dihydroneopterin aldolase  27.52 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000191063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  33.05 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  31.68 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0098  dihydroneopterin aldolase; RBL03201  38.78 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.473342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  36.63 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  29.7 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.66 
 
 
337 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  28.71 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.76 
 
 
310 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1274  dihydroneopterin aldolase  30.36 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.436023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  27.72 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  32.32 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33546  predicted protein  31.31 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183878  hitchhiker  0.00808853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  32.67 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  28.16 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.65 
 
 
841 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  34.29 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.77 
 
 
305 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.66 
 
 
612 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  33.96 
 
 
470 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  31.78 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  26.21 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>