112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1032 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
121 aa  240  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  59.32 
 
 
119 aa  140  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03415  FolB  55.08 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  37.27 
 
 
117 aa  89  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  36.13 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  37.7 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  32.43 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  39.29 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  39.29 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  37.5 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  32.38 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  32.23 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  38.39 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  30.7 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  31.09 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  30.25 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6235  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.353905  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  34.21 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  30.17 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2328  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  29.7 
 
 
125 aa  60.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  27.12 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  30.25 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  31.09 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  33.98 
 
 
125 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  29.91 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  31.78 
 
 
126 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  26.96 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  32.2 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  27.73 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  26.89 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
470 aa  55.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  32.04 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  25.42 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.17 
 
 
292 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  31.68 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  25.83 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  26.89 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  27.12 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  31.09 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  29.7 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  26.27 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0591  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 
120 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  29.31 
 
 
122 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  26.27 
 
 
125 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  30.25 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 
122 aa  50.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06561  dihydroneopterin aldolase  31.53 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  32.73 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 
123 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  25.21 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06171  dihydroneopterin aldolase  31.19 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  27.73 
 
 
305 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  24.37 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  30.51 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06471  dihydroneopterin aldolase  30.56 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1274  dihydroneopterin aldolase  28.45 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.436023  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0444  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1910  dihydroneopterin aldolase  38.71 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0457  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660964  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  30.17 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10591  dihydroneopterin aldolase  25.69 
 
 
127 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279574  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 
121 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  28.18 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  30.17 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  25.86 
 
 
276 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  31.9 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0027  dihydroneopterin aldolase  26.96 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0928  dihydroneopterin aldolase family protein  27.35 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33546  predicted protein  26.61 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183878  hitchhiker  0.00808853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06471  dihydroneopterin aldolase  26.96 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.147381  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  26.05 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  26.05 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  30.21 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>