56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2328 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2328  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  35.92 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6235  dihydroneopterin aldolase  36.94 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.353905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03415  FolB  33.98 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  33.63 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  31.13 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  29.31 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  28.95 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  30.19 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  30.19 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  30.19 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  30.19 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  30.19 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  30.19 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  30.19 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  29.25 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  25.69 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  29.25 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  29.25 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  26.96 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  24.78 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  23.42 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  28.07 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.31 
 
 		 333 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  22.12 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  27.27 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  24.76 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  25.96 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  26.96 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  27.42 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  25.96 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  26.79 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.26 
 
 		 292 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  28.85 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  28.85 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  26.96 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  25.45 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0444  dihydroneopterin aldolase  32.69 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  25.96 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0457  dihydroneopterin aldolase  32.69 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660964  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  24.76 
 
 		 305 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  25.69 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  24 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  24.76 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  23.81 
 
 		 119 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  26.09 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  23.89 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  22.12 
 
 		 121 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  25.42 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  25.44 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  27.62 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  27.62 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  25.21 
 
 		 138 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>