72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6235 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6235  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 116 aa  236  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.353905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  37.07 
 
 		 116 aa  94.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  37.07 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  34.23 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2328  dihydroneopterin aldolase  36.94 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  30.63 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  30.39 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  29.73 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  29.29 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03415  FolB  31.73 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  27.12 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  26.27 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  27.36 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  27.36 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  25.64 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  28.85 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  26.47 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  28.42 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  32 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  27.45 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  30.3 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  27.12 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  42.42 
 
 		 333 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  28.16 
 
 		 129 aa  47.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  29.41 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  25.71 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  27.12 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  26.47 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  26.42 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  28.24 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  28.43 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  28.43 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1274  dihydroneopterin aldolase  29.25 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.436023  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  33.78 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  26.47 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  27.96 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  27.1 
 
 		 1211 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  22.5 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  22.12 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  26.17 
 
 		 155 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  25.69 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  30.53 
 
 		 124 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  25.42 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  26.09 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  26.61 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  25.47 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  27.66 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  34.85 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  26.17 
 
 		 120 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  24.79 
 
 		 124 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>