146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2140 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 125 aa  258  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  64.52 
 
 		 125 aa  170  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  65.25 
 
 		 125 aa  167  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  61.6 
 
 		 125 aa  167  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  66.95 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  58.2 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  49.17 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  45.16 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  40.91 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  40.91 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  41.82 
 
 		 119 aa  96.7  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  40.17 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  42.48 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  41.59 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  39.09 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  40 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  39.13 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  36.94 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  39.6 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  38.54 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  35.42 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  31.82 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  29.84 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  32.69 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  35.58 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  37.74 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  39.39 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  30.3 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  30.3 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  30.3 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  30.3 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  37.62 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  30.3 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  30.3 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  30.3 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  30.3 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  30.3 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  35.29 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  32.69 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  29.29 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.13 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  31.73 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  34.95 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  27.27 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  36.13 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  36.19 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 		 130 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  36.75 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  32.67 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  31.73 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  30.91 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  32.38 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  27.52 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  27.52 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  31.71 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  34.31 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.09 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  31.78 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  37.25 
 
 		 310 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  32.35 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  37.25 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03415  FolB  31.07 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1274  dihydroneopterin aldolase  34.23 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.436023  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  30.11 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  29.91 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  29.52 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.77 
 
 		 337 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  29.31 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 470 aa  56.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5757  dihydroneopterin aldolase  32.35 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1675  dihydroneopterin aldolase  31.37 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0522559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  29 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1099  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.77 
 
 		 273 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00662254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  25.89 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.16 
 
 		 841 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  28.71 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0591  dihydroneopterin aldolase  30.1 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  29.25 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  29.7 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33546  predicted protein  30.93 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183878  hitchhiker  0.00808853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  33.66 
 
 		 525 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  27.72 
 
 		 1211 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  26.6 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1277  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.47 
 
 		 273 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00023315  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06171  dihydroneopterin aldolase  31.07 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.68 
 
 		 612 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  29.91 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  25.49 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  34.58 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>