106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0506 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
130 aa  265  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  98.31 
 
 
123 aa  235  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  91.53 
 
 
123 aa  221  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  86.29 
 
 
125 aa  214  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  89.83 
 
 
123 aa  214  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  87.29 
 
 
130 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  88.98 
 
 
150 aa  211  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  85.59 
 
 
123 aa  206  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  83.9 
 
 
124 aa  202  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  31.53 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  27.87 
 
 
132 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  28.71 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  25 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  34.69 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.53 
 
 
612 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  31.97 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 
311 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 
300 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  29.91 
 
 
300 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  31.19 
 
 
117 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  30.61 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  34.48 
 
 
124 aa  53.9  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  31.19 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  24.79 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  33.67 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  32.73 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  29.91 
 
 
470 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  30.09 
 
 
525 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  30.28 
 
 
118 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  29.66 
 
 
306 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  28.21 
 
 
312 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  26.85 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  27.96 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  27.97 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  32.29 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  30.36 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.74 
 
 
841 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  30.93 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  30.69 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  27.93 
 
 
131 aa  47.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  27.96 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6489  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal  0.299882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  27.64 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  30.39 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0534  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  30.39 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  30.39 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  30.39 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  30.39 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  30.39 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  28.23 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  32.63 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32 
 
 
1211 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  27.66 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1246  dihydroneopterin aldolase  27.66 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0419783  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  29.9 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  27.66 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.08 
 
 
305 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  30.23 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04103  dihydroneopterin aldolase  29.9 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  30.93 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2988  dihydroneopterin aldolase  30.85 
 
 
121 aa  42.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  25.69 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  30.21 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  32 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  25.45 
 
 
291 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24750  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.82 
 
 
295 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  27.84 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0098  dihydroneopterin aldolase; RBL03201  34.41 
 
 
123 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.473342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  27.27 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33 
 
 
337 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.87 
 
 
292 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.29 
 
 
310 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0619  dihydroneopterin aldolase  34.43 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  26.27 
 
 
283 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3078  dihydroneopterin aldolase  27.93 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  32.29 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0193  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 
121 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.600595  normal  0.861328 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>