101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0814 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 130 aa  266  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  84.43 
 
 		 124 aa  214  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  87.29 
 
 		 123 aa  213  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  87.29 
 
 		 130 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  84.3 
 
 		 123 aa  211  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  85.59 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  86.44 
 
 		 125 aa  208  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  79.34 
 
 		 123 aa  203  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  83.9 
 
 		 150 aa  202  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  27.88 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  25.21 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  25.21 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  26.92 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  31.62 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  31.11 
 
 		 300 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  28.72 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  31.11 
 
 		 311 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  34.21 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  29.03 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  34.74 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  33.9 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  31.11 
 
 		 300 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  27.73 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  35.35 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  34 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  31.48 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  26.42 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  27.88 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  26.42 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  27.96 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  29.59 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1246  dihydroneopterin aldolase  28.72 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0419783  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  30.7 
 
 		 470 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04103  dihydroneopterin aldolase  32.99 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  30.28 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  32.67 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  31.63 
 
 		 312 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  28.72 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  26.42 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  26.42 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.45 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1910  dihydroneopterin aldolase  30.12 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  34.38 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  26.42 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  29.59 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24750  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  35.23 
 
 		 295 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.74 
 
 		 841 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  30.51 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2988  dihydroneopterin aldolase  32.29 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0619  dihydroneopterin aldolase  35.65 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  28.72 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  27.83 
 
 		 612 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  28.1 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  32.73 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0193  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.600595  normal  0.861328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0039  dihydroneopterin aldolase family protein  29.17 
 
 		 125 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  29.9 
 
 		 118 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  26.92 
 
 		 283 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6489  dihydroneopterin aldolase  32.04 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal  0.299882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  27.83 
 
 		 525 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  28.89 
 
 		 306 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  28.04 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  28.04 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  28.04 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0794  dihydroneopterin aldolase  27.91 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.19787  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.6 
 
 		 1211 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1182  dihydroneopterin aldolase  27.66 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.4 
 
 		 337 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  37.33 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1802  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0665  dihydroneopterin aldolase  24.77 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0115  dihydroneopterin aldolase  27.73 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29 
 
 		 292 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.33 
 
 		 310 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  33.68 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  33.33 
 
 		 126 aa  40  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0098  dihydroneopterin aldolase; RBL03201  32.14 
 
 		 123 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.473342  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  34.02 
 
 		 145 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>