113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2979 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
134 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  95.49 
 
 
134 aa  258  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  95.49 
 
 
134 aa  258  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  94.74 
 
 
163 aa  257  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  94.74 
 
 
134 aa  256  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  88.72 
 
 
143 aa  245  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  87.97 
 
 
139 aa  245  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  88.72 
 
 
134 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  88.72 
 
 
134 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  88.72 
 
 
134 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  88.72 
 
 
134 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  88.72 
 
 
134 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  88.72 
 
 
134 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  70.99 
 
 
131 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  72.31 
 
 
130 aa  201  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  70.99 
 
 
131 aa  201  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  68.99 
 
 
133 aa  192  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  71.43 
 
 
130 aa  190  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  67.97 
 
 
132 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  64.89 
 
 
132 aa  186  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  64.62 
 
 
132 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  65.12 
 
 
132 aa  184  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  59.69 
 
 
131 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  59.84 
 
 
133 aa  160  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  57.52 
 
 
121 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  44.8 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  39.1 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  40.31 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0115  dihydroneopterin aldolase  35.83 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379308  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  39.02 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 
283 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 
300 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 
300 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 
306 aa  62.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 
311 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  38.6 
 
 
272 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  36.75 
 
 
396 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.63 
 
 
291 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  31.03 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  38.39 
 
 
397 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  29.31 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  25.89 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
125 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
125 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  28.45 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  27.59 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  31 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  32.67 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  27.36 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  27.19 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  23.01 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0052  putative dihydroneopterin aldolase FolB  24.78 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148451  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  32.35 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  27.88 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  23.89 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  29.17 
 
 
312 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  34 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  23.21 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2828  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0032531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1002  dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00980814  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1046  dihydroneopterin aldolase  25.89 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0337595  normal  0.538227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 
116 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  33 
 
 
125 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 
117 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2988  dihydroneopterin aldolase  26.79 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0829  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000184652  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  26.42 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2438  dihydroneopterin aldolase  25.21 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  26.32 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3078  dihydroneopterin aldolase  25.89 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  21.43 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  31.4 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2692  dihydroneopterin aldolase  26.96 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00414447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  25.89 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  35.63 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3146  dihydroneopterin aldolase  27.78 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0039  dihydroneopterin aldolase family protein  23.21 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0663  dihydroneopterin aldolase  27.62 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4345  dihydroneopterin aldolase  30.93 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0794  dihydroneopterin aldolase  26.09 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.19787  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2990  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.472635  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0828  dihydroneopterin aldolase  23.21 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>