87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3577 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 397 aa  795    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  43.17 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2277  dihydroneopterin aldolase  45.13 
 
 		 135 aa  90.5  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  47.41 
 
 		 139 aa  90.1  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1243  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  87  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  43.44 
 
 		 143 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  35.65 
 
 		 132 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  41.38 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  41.75 
 
 		 143 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  36.94 
 
 		 133 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  34.82 
 
 		 132 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  41.75 
 
 		 139 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2399  putative dihydroneopterin aldolase  34.68 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  33.93 
 
 		 131 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4098  hypothetical protein  34.21 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  36.61 
 
 		 130 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  41.75 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  41.75 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  41.75 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  41.75 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  41.75 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  39.29 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  39.29 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  41.75 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0543  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.968612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  38.39 
 
 		 134 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  38.39 
 
 		 134 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  38.39 
 
 		 134 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  37.84 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  38.39 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  32.43 
 
 		 121 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  37.5 
 
 		 163 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  32.56 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2179  hypothetical protein  37.25 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5319  hypothetical protein  36.27 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  34.78 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  32.61 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  32.61 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1844  hypothetical protein  36.27 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0020  hypothetical protein  40.21 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 131 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1795  hypothetical protein  36.79 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0193  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 		 121 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.600595  normal  0.861328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0794  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 		 120 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.19787  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2723  hypothetical protein  37.78 
 
 		 233 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.214242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4345  dihydroneopterin aldolase  39.36 
 
 		 143 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 121 aa  53.1  0.000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2063  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 119 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.424168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0828  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 		 117 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  36.36 
 
 		 137 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  29.31 
 
 		 120 aa  50.4  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2456  hypothetical protein  26.69 
 
 		 247 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0904442  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5015  hypothetical protein  34.11 
 
 		 234 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  27.19 
 
 		 124 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  28.24 
 
 		 118 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3073  hypothetical protein  33.01 
 
 		 234 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1579  hypothetical protein  26.16 
 
 		 236 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000182235  unclonable  0.000000174169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2990  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 117 aa  46.6  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.472635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 116 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 116 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0534  dihydroneopterin aldolase  33.67 
 
 		 116 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 		 116 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0039  dihydroneopterin aldolase family protein  29.84 
 
 		 125 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  28.81 
 
 		 134 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2618  hypothetical protein  34.44 
 
 		 227 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0343997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4295  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.66 
 
 		 119 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00183631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 116 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3569  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.17 
 
 		 117 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 116 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 		 126 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 116 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 116 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 116 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 		 119 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  26.55 
 
 		 119 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3562  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.09 
 
 		 119 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0891124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3392  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.09 
 
 		 119 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000166659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3396  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.09 
 
 		 119 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3460  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.09 
 
 		 119 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.125867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3466  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.09 
 
 		 119 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 		 117 aa  42.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>