39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2723 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2723  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.214242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1844  hypothetical protein  58.95 
 
 
236 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2179  hypothetical protein  58.33 
 
 
236 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1795  hypothetical protein  57.96 
 
 
223 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5319  hypothetical protein  54.42 
 
 
238 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1243  hypothetical protein  43.05 
 
 
236 aa  142  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5015  hypothetical protein  53.24 
 
 
234 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  44.76 
 
 
396 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0020  hypothetical protein  38.33 
 
 
233 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4098  hypothetical protein  42.26 
 
 
246 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64495  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1579  hypothetical protein  37.14 
 
 
236 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000182235  unclonable  0.000000174169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2456  hypothetical protein  36.12 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0904442  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3141  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6499  hypothetical protein  38.84 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670361  normal  0.0462955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2618  hypothetical protein  38.1 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0343997  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3073  hypothetical protein  36.57 
 
 
234 aa  92  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1735  hypothetical protein  33.48 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.370565 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0176  hypothetical protein  34.4 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0868  hypothetical protein  34.4 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1240  hypothetical protein  30.38 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1586  hypothetical protein  33.03 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1101  hypothetical protein  30.45 
 
 
234 aa  72  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0348  hypothetical protein  34.02 
 
 
234 aa  72  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.773589  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1676  hypothetical protein  29.26 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0482  hypothetical protein  31.6 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5939  hypothetical protein  34.96 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471017  normal  0.0147378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  37.78 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1383  hypothetical protein  28.88 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2711  hypothetical protein  34.01 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2631  hypothetical protein  30.95 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1569  hypothetical protein  30.6 
 
 
229 aa  62  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.862522  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1717  hypothetical protein  30.62 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.757154  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2061  hypothetical protein  32.55 
 
 
228 aa  55.1  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0162  quinolinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
297 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0158  quinolinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0159  quinolinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0157  quinolinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0165  quinolinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
311 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1972  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.35 
 
 
274 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>