33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6499 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6499  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  454  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670361  normal  0.0462955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2456  hypothetical protein  66.22 
 
 
247 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0904442  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3073  hypothetical protein  47.96 
 
 
234 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5939  hypothetical protein  47.06 
 
 
257 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471017  normal  0.0147378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3141  hypothetical protein  42.73 
 
 
252 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2618  hypothetical protein  40.27 
 
 
227 aa  129  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0343997  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1243  hypothetical protein  36.17 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4098  hypothetical protein  36.84 
 
 
246 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64495  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2723  hypothetical protein  38.84 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.214242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0020  hypothetical protein  32.58 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1579  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000182235  unclonable  0.000000174169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  34.62 
 
 
396 aa  85.1  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0348  hypothetical protein  31.05 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.773589  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1844  hypothetical protein  36.94 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2179  hypothetical protein  36.49 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1795  hypothetical protein  36.77 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1569  hypothetical protein  28.88 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.862522  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0482  hypothetical protein  28.45 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5319  hypothetical protein  34.1 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0868  hypothetical protein  29.36 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0176  hypothetical protein  29.06 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1735  hypothetical protein  28.21 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.370565 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1586  hypothetical protein  27.23 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2711  hypothetical protein  29.2 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1101  hypothetical protein  26.38 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1717  hypothetical protein  26.91 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.757154  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1676  hypothetical protein  25.11 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5015  hypothetical protein  36.22 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2061  hypothetical protein  29.6 
 
 
228 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2631  hypothetical protein  24.9 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1240  hypothetical protein  23.73 
 
 
281 aa  55.5  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1383  hypothetical protein  24.18 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.13 
 
 
354 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>