33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5015 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5015  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5319  hypothetical protein  74.88 
 
 
238 aa  241  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2179  hypothetical protein  57.33 
 
 
236 aa  187  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1844  hypothetical protein  57.33 
 
 
236 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2723  hypothetical protein  53.54 
 
 
233 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.214242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1795  hypothetical protein  56.31 
 
 
223 aa  158  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0020  hypothetical protein  41.36 
 
 
233 aa  145  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1243  hypothetical protein  42.86 
 
 
236 aa  136  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4098  hypothetical protein  44.12 
 
 
246 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64495  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  46.48 
 
 
396 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1579  hypothetical protein  36.61 
 
 
236 aa  118  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000182235  unclonable  0.000000174169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3073  hypothetical protein  41.03 
 
 
234 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2456  hypothetical protein  39.3 
 
 
247 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0904442  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2618  hypothetical protein  39.44 
 
 
227 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0343997  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3141  hypothetical protein  38.56 
 
 
252 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1586  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  99  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193654  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0868  hypothetical protein  33.03 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0176  hypothetical protein  31.65 
 
 
236 aa  91.7  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1735  hypothetical protein  31.19 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.370565 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5939  hypothetical protein  35.86 
 
 
257 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471017  normal  0.0147378 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6499  hypothetical protein  37.61 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670361  normal  0.0462955 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0482  hypothetical protein  30.34 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1101  hypothetical protein  27.6 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2631  hypothetical protein  28.63 
 
 
228 aa  72  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2711  hypothetical protein  31.3 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1717  hypothetical protein  29.82 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.757154  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1676  hypothetical protein  29.22 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2061  hypothetical protein  31.65 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1569  hypothetical protein  31.48 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.862522  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0348  hypothetical protein  31.65 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.773589  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1383  hypothetical protein  28.14 
 
 
229 aa  62  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1240  hypothetical protein  25.44 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  33.83 
 
 
397 aa  58.9  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>