32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1569 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1569  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  460  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.862522  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1717  hypothetical protein  72.89 
 
 
228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.757154  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2631  hypothetical protein  67.69 
 
 
228 aa  290  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1383  hypothetical protein  65.5 
 
 
229 aa  285  4e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2061  hypothetical protein  69.43 
 
 
228 aa  271  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1101  hypothetical protein  60.79 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0348  hypothetical protein  53.33 
 
 
234 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.773589  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1676  hypothetical protein  54.63 
 
 
230 aa  215  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0482  hypothetical protein  50.22 
 
 
235 aa  203  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2711  hypothetical protein  50.23 
 
 
250 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1735  hypothetical protein  49.79 
 
 
236 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.370565 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0868  hypothetical protein  51.83 
 
 
236 aa  198  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1586  hypothetical protein  47.48 
 
 
236 aa  196  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193654  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0176  hypothetical protein  51.83 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1579  hypothetical protein  36.41 
 
 
236 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000182235  unclonable  0.000000174169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1243  hypothetical protein  34.58 
 
 
236 aa  94.7  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2618  hypothetical protein  31.54 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0343997  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3141  hypothetical protein  29.18 
 
 
252 aa  79  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1844  hypothetical protein  32.19 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0020  hypothetical protein  28.24 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4098  hypothetical protein  29.65 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64495  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3073  hypothetical protein  29.96 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2179  hypothetical protein  31.76 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  31.31 
 
 
396 aa  71.6  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6499  hypothetical protein  28.45 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670361  normal  0.0462955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1795  hypothetical protein  31.56 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2456  hypothetical protein  27.56 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0904442  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1240  hypothetical protein  26.25 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5319  hypothetical protein  30.59 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5939  hypothetical protein  27.65 
 
 
257 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471017  normal  0.0147378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2723  hypothetical protein  29.31 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.214242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5015  hypothetical protein  29.57 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  normal  0.0136961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>