32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2711 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2711  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  497  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0482  hypothetical protein  58.08 
 
 
235 aa  268  5e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0868  hypothetical protein  58.08 
 
 
236 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1586  hypothetical protein  57.64 
 
 
236 aa  260  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193654  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1735  hypothetical protein  56.77 
 
 
236 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.370565 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0176  hypothetical protein  56.77 
 
 
236 aa  255  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0348  hypothetical protein  49.36 
 
 
234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.773589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1101  hypothetical protein  49.79 
 
 
234 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1569  hypothetical protein  50.23 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.862522  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1676  hypothetical protein  46.61 
 
 
230 aa  185  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1717  hypothetical protein  47.27 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.757154  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2631  hypothetical protein  44.98 
 
 
228 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1383  hypothetical protein  44.54 
 
 
229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2061  hypothetical protein  46.61 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1579  hypothetical protein  34.1 
 
 
236 aa  92  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000182235  unclonable  0.000000174169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0020  hypothetical protein  27.08 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2456  hypothetical protein  32.66 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0904442  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1243  hypothetical protein  30.74 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  32.32 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4098  hypothetical protein  30.61 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64495  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3141  hypothetical protein  28.32 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2618  hypothetical protein  32 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0343997  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3073  hypothetical protein  31.8 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6499  hypothetical protein  27.75 
 
 
232 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670361  normal  0.0462955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2723  hypothetical protein  33.6 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.214242 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5939  hypothetical protein  29.06 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471017  normal  0.0147378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5015  hypothetical protein  29.35 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5319  hypothetical protein  36.36 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1795  hypothetical protein  30.1 
 
 
223 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2179  hypothetical protein  28.11 
 
 
236 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1844  hypothetical protein  28.11 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1240  hypothetical protein  26.24 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>