33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1101 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1101  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  473  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1676  hypothetical protein  67.97 
 
 
230 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0348  hypothetical protein  60.96 
 
 
234 aa  292  4e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.773589  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1569  hypothetical protein  60.79 
 
 
229 aa  268  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.862522  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0482  hypothetical protein  52.77 
 
 
235 aa  240  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2631  hypothetical protein  58.26 
 
 
228 aa  234  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1735  hypothetical protein  50.64 
 
 
236 aa  234  8e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.370565 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0868  hypothetical protein  50.64 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0176  hypothetical protein  50.21 
 
 
236 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1586  hypothetical protein  48.09 
 
 
236 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1717  hypothetical protein  56.65 
 
 
228 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.757154  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1383  hypothetical protein  54.59 
 
 
229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2061  hypothetical protein  57.51 
 
 
228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2711  hypothetical protein  49.79 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1579  hypothetical protein  36.84 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000182235  unclonable  0.000000174169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0020  hypothetical protein  31.94 
 
 
233 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1243  hypothetical protein  32.71 
 
 
236 aa  92.8  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3073  hypothetical protein  30.84 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2618  hypothetical protein  31.78 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0343997  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1844  hypothetical protein  29.06 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2179  hypothetical protein  29.44 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3141  hypothetical protein  29.41 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4098  hypothetical protein  29.63 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64495  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1795  hypothetical protein  30.36 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5319  hypothetical protein  28.05 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  30.14 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2456  hypothetical protein  28.81 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0904442  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2723  hypothetical protein  30.91 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.214242 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5939  hypothetical protein  28.45 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471017  normal  0.0147378 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1240  hypothetical protein  27.91 
 
 
281 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6499  hypothetical protein  27.12 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670361  normal  0.0462955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5015  hypothetical protein  34.78 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  26.32 
 
 
291 aa  43.5  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>